Basic Information

Symbol
VPS13C
RNA class
mRNA
Alias
Vacuolar Protein Sorting 13 Homolog C KIAA1421 BLTP5C PARK23 Bridge-Like Lipid Transfer Protein Family Member 5C Vacuolar Protein Sorting-Associated Protein 13C Intermembrane Lipid Transfer Protein VPS13C FLJ20136 FLJ10381 Vacuolar Protein Sorting 13 Homolog C (S. Cerevisiae) Vacuolar Protein Sorting 13C (Yeast)
Location (GRCh38)
15:61852389-62060473
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020821.3
Sequence length
13403.0 nt
GC content
0.3885

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3551.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3813.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 4551.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001018088.3 NCBI
GCAGCGCUGGUCGCAGCCCUCAGCUGCGCCGGGCGGUUCCGGCUCCUCC… 14578 nt 0.3712
NM_017684.5 NCBI
GCAGCGCUGGUCGCAGCCCUCAGCUGCGCCGGGCGGUUCCGGCUCCUCC… 13274 nt 0.3887
NM_018080.4 NCBI
GCAGCGCUGGUCGCAGCCCUCAGCUGCGCCGGGCGGUUCCGGCUCCUCC… 14449 nt 0.3712
NM_020821.3 NCBI
GCAGCGCUGGUCGCAGCCCUCAGCUGCGCCGGGCGGUUCCGGCUCCUCC… 13403 nt 0.3885
Summary

Involved in mitochondrion organization and negative regulation of type 2 mitophagy. Located in several cellular components, including late endosome; lipid droplet; and mitochondrial outer membrane. Implicated in Parkinson's disease 23. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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