Basic Information

Symbol
WDR27
RNA class
mRNA
Alias
WD Repeat Domain 27 WD Repeat-Containing Protein 27 MGC43690
Location (GRCh38)
6:169457211-169702729
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182552.5
Sequence length
3554.0 nt
GC content
0.5312

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1288.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1352.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1023.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001202550.2 NCBI
AACCAUAGCGGCUCGCGUGGGUCGGCUGGCAAGUAACCAUAGCGGCGAG… 3051 nt 0.5300
NM_001350623.2 NCBI
AACCAUAGCGGCUCGCGUGGGUCGGCUGGCAAGUAACCAUAGCGGCGAG… 2712 nt 0.5347
NM_001350624.2 NCBI
AACCAUAGCGGCUCGCGUGGGUCGGCUGGCAAGUAACCAUAGCGGCGAG… 2151 nt 0.5202
NM_001350625.2 NCBI
AACCAUAGCGGCUCGCGUGGGUCGGCUGGCAAGUAACCAUAGCGGCGAG… 1969 nt 0.5272
NM_182552.5 NCBI
AACCAUAGCGGCUCGCGUGGGUCGGCUGGCAAGUAACCAUAGCGGCGAG… 3554 nt 0.5312
Summary

This gene encodes a protein with multiple WD repeats. Proteins with these repeats may form scaffolds for protein-protein interaction and play key roles in cell signalling. Alternative splicing results in multiple transcript variants, but the full-length structure of some of these variants cannot be determined. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

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