Basic Information

Symbol
WIF1
RNA class
mRNA
Alias
Wnt Inhibitory Factor 1 WIF-1
Location (GRCh38)
12:65050626-65121548
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007191.5
Sequence length
1977.0 nt
GC content
0.4390

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-591.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -628.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 443.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007191.5 NCBI
AAACGGGAACAGCCCUGGCUGAGGGAGCUGCAGCGCAGCAGAGUAUCUG… 1977 nt 0.4390
Summary

The protein encoded by this gene functions to inhibit WNT proteins, which are extracellular signaling molecules that play a role in embryonic development. This protein contains a WNT inhibitory factor (WIF) domain and five epidermal growth factor (EGF)-like domains, and is thought to be involved in mesoderm segmentation. This gene functions as a tumor suppressor gene, and has been found to be epigenetically silenced in various cancers. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in zebrafish and mouse demonstrated that the WIF1 transcript, a WNT inhibitor involved in development and cancer, increased in relative abundance at 0.3 hours postmortem in zebrafish [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].