Basic Information

Symbol
YEATS2
RNA class
mRNA
Alias
YEATS Domain Containing 2 KIAA1197 YEATS Domain-Containing Protein 2 FLJ10201 FLJ12841 FLJ13308 FAME4
Location (GRCh38)
3:183697748-183812805
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018023.5
Sequence length
6526.0 nt
GC content
0.5058

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2203.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2316.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1857.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001351369.2 NCBI
GCUCAUGUUUCCUUUUCAUAAAAUCUACAAGUCAGACAAGAAGAGUCCA… 6382 nt 0.4962
NM_001351370.2 NCBI
GACGCGCCCAGCUGCUGACGUGCGGGGCGGAACGCGCCGGGCGGGCUCC… 6529 nt 0.5059
NM_001351371.2 NCBI
GACGCGCCCAGCUGCUGACGUGCGGGGCGGAACGCGCCGGGCGGGCUCC… 3688 nt 0.4930
NM_018023.5 NCBI
GACGCGCCCAGCUGCUGACGUGCGGGGCGGAACGCGCCGGGCGGGCUCC… 6526 nt 0.5058
Summary

Summary: The protein encoded by this gene is a scaffolding subunit of the ATAC complex, which is a complex with acetyltransferase activity on histones H3 and H4. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, May 2017]

Forensic Context

A study in zebrafish and mouse demonstrated that the YEATS2 transcript, a histone acetylation reader involved in epigenetic regulation, increased in relative abundance within 0.5 hours postmortem in mouse tissues [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].