Basic Information

Symbol
BRINP1
RNA class
mRNA
Alias
BMP/Retinoic Acid Inducible Neural Specific 1 FAM5A DBCCR1 DBC1 Bone Morphogenetic Protein/Retinoic Acid Inducible Neural-Specific 1 Deleted In Bladder Cancer Chromosome Region Candidate 1 BMP/Retinoic Acid-Inducible Neural-Specific Protein 1 Deleted In Bladder Cancer Protein 1 Deleted In Bladder Cancer 1 BA574M5.1 (Deleted In Bladder Cancer Chromosome Region Candidate 1 (IB3089A)) Bone Morphogenic Protein/Retinoic Acid Inducible Neural-Specific 1
Location (GRCh38)
9:119153458-119369515
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014618.3
Sequence length
3171.0 nt
GC content
0.5336

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1083.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1143.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 729.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014618.3 NCBI
AUUCGCCAGCCGCCUCGCUCCCGGACCCCACGGCUGCAAACUGAUCUGG… 3171 nt 0.5336
Summary

This gene is located within a chromosomal region that shows loss of heterozygosity in some bladder cancers. It contains a 5' CpG island that may be a frequent target of hypermethylation, and it may undergo hypermethylation-based silencing in some bladder cancers. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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