Basic Information

Symbol
ZC3H13
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger CCCH-Type Containing 13 KIAA0853 Xio Zinc Finger CCCH Domain-Containing Protein 13 DKFZp434D1812
Location (GRCh38)
13:45954364-46052781
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001330564.2
Sequence length
8024.0 nt
GC content
0.4163

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2051.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2208.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1899.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001382211.1 NCBI
AAACCUCUGACUUCCGGCGGCAUUUUGAGGCGGUCCUCCUAGCGGCCUG… 8108 nt 0.4177
NM_001382212.1 NCBI
AAACCUCUGACUUCCGGCGGCAUUUUGAGGCGGUCCUCCUAGCGGCCUG… 7811 nt 0.4096
NM_001382213.1 NCBI
AAACCUCUGACUUCCGGCGGCAUUUUGAGGCGGUCCUCCUAGCGGCCUG… 8105 nt 0.4176
NM_001382214.1 NCBI
AAACCUCUGACUUCCGGCGGCAUUUUGAGGCGGUCCUCCUAGCGGCCUG… 7382 nt 0.4054
NM_015070.6 NCBI
AAACCUCUGACUUCCGGCGGCAUUUUGAGGCGGUCCUCCUAGCGGCCUG… 6399 nt 0.4301
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary

Enables RNA binding activity. Involved in mRNA processing. Located in nuclear speck. Part of RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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