Basic Information

Symbol
ZC3H7A
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger CCCH-Type Containing 7A HSPC055 ZC3HDC7 ZC3H7 Zinc Finger CCCH Domain-Containing Protein 7A Zinc Finger CCCH-Type Domain Containing 7 FLJ20318 Zinc Finger CCCH-Type Containing 7 Zinc-Finger Protein AY163807
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_014153.4
Sequence length
3805.0 nt
GC content
0.4124

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1014.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1092.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 860.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((.(((..((...))..))).))).))).)))..(((((...((.((....)).))....((.(((.(((.((.((.((..((....))..)).....)).)).))).)))))(((((..((..(((((.(((((........(((((((((......))))))))).(((((((..(((...........((((((..........((...(((((.........))))).))))))))...))).)).)))))((((((...(((((.....))))))))))).))))).)))))..........))..)))))((((((((((................))))))))))(((((((.((...(((((..(((((.(((.((((((((...........(((((((.............)))))))..........((((((((..((((............(((((((((...(((.(((((((((((((((.....))))))))((((...........)))).))))))).)))...)))))))))))))..))..))))))((((((((((.....((((((.(((.(((.((..(((...(((((((((..((((((((((((((((((((.........(((((...((.....))...)))))..........(((((((((((((.((((((...((((((............(((..(((((((((((.....)))).....)))))))..)))((..((((((((((.((((((...(((((.((.....)).....(((.((((........))))..)))..((((....))))))))))))))))))).))))))..))((((......))))..........(((((...)))))..)))))))))))).)))..))....((((((..((((((........))))))...))))))..)))))))).((.((.((((....(((((((.....(((.(((((((((..((.((((........................)))).)).))))..))))))))))))))).....(((((.....))))).((((((((((((......))))....))))))))............((((.((((......)))))))))))).))))(((((((((((((((((...((((.(((((((((((.......))))))....((((((((.....)))))))).(((((((((((((((((..(((.......(((((((((....(((.......))).....))))))))).....))).)))).)))))..)))))))).((((((((((((((.((..(((((.((.....)).)))))..))..))))).))))))))).((((((((((...(((((((...((((((..(((.........(((...)))...........(((((...((..(((((.(((((............(((((.(((((....)))))..((((((.((((........((((((.(((......((((((((.(((.....)))..)))))))).........((.((((..........)))).)).........)))..)))))).....(((((...))))).......(((((((((.(((((((((...(((((....((((.((((............(((((.(((.(((.....((((((((((((....(((((((((....((((....)))).(((((.((((.((((....(((...(((((.(((.(((((((((((((((((...)))))))))..(((((......)))))...((((((((......((((......((((((((..((((.((....)).))))..)))))))).......)))).)))))))).)))))))).))).)))).)....)))..)))))))).)))))....((((...)))).........)))))))))....))))))))(((((.((((.......(((((((((((((((((((((((..((((((.((.(((((.......((((..((((((...(((((....((((..................((((((......))))))(((((((..((((((((((.(((((((((...(((((((((((..(((((((.....)))))))..((((.........))))......((((......)))).....(((((.((.(..(((((.((((.......)).)).)))))..))).))))).(((((....((((((((((....)))(((((((.((((........)).((((.((((.(((......))))))).))))....((.(((((......))))).))............)).))))))))))))))....))))).........)))))))))))......)))))))))...........(((((((.((((......)))).)))).))))))))))))).(((........)))..............)))))))........(((((..(((....(((......)))......)))...))))))))))))))...))))))...))))...............((((.(((....((((.........((((.(((((((((((...(((((((......)))).)))......)))))))).))).)))).((((....)))))))).........((((.(((.......))).))))....))).))))))))))))))))).....(((((((..(((((((...)))))))..))))))).(((.......)))))))))))(((....)))........)))))))))))))))...(((...............)))...)))).)))))........)))).....))).)))..)))))(((((..........))))).......(((.....((((((....))))))......)))(((((((.((((((...((...((((((((((...(((.....)))..))))))))))))..))).))).)))))))((((.....)))).)))).))))..)))))))))))))).)))))))))....)))))))))).....))))).....))))).)))))...))))))).)))..))))))....)))))))...)))))))).)).(((.......)))...((((.(((((.....))))).))))))))).))))..)))))(((((..((((((((((...))))).)))))..)))))..........(((((.(((........))).)))))..((((.......)))))))))))))))))))))))...(((((((......((((.....)))).....))))))))))))))...)).)))))))))...))))....)))..)))))))).))))))......((((((((((........)))))))))).))))))))))...))))))))..)))))))).))))).......((((((.((...(((((...(((.........)))...))))))).)))))).((((((((((...(((........)))...)))))))))).)))))))))..(((((((.(((........)))))))))))))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{((((((((.(({..{,,,{|},{}||.|||.|||.||,..(((((...((.((.{{.|,.}}....}}.}|..}}}}},.}}}|}.}||,...|}},,},,,..)}.),,))),))))}{({((,{(({{(,(({.{(({{,.....,,|||||{|||,}}...}}||}}}},.|{{{(((..{{{...........((((((..........((...(((((.,.......))))).}}}))|||,,.|||.}},.|||,((((({..,(((((.....))))))))))).)))}|..,|||{{,....},,))}.}))))((((((((((..,,....,,......))))))))))(((((((.((...((((,..(((((.(((.((((((({..,.,..,...,{{{,,,..............}}},...........,{(((((((..((((............(((((((((..,(((.(((((((((((((((.....)))))))),((,.......,,,.,,)),))))))).}}),,,)))))))))))))..))..)))))}|(((((((((.....((((((.(((.(((.((.,(((,.,({{((((((..((((((((((((((((((((.........{{{{{...,{..,,,||...}))))..........(((((((({,(((.((((((...((((((.......,,..{(((..((((((({{({.....}))}.....)))))))..)))||,.((((((((((.((((((...((({{{{{{{({{({({...|}}}|||{},,,..,,||},.,|||,,{{{{....)))}))))})))))))))),,))))),,},((((......)))),,,,,..,,.{((({.,,))))),,)))))))))))).))}.,}}....((((((..((((((........)))))).,.))))))..)))))))).((.((.((((....(((((((.....(({,(((({((((..((.{(((....|,...........,}.....)))).)).))))..)))))))}))))))).....(((((.....))))).((((((((((((......)))),...))))))))............((((.((((......)))))))))))).))))(((((((((((({(({,...((((,((({,((((((.......))))))....((((((((.....)))))))).((((((({(((((((((..(((.......(((((((((....(((.......))).....))))))))).....))).))))}}))))..}))))))){{{(((((({{((((.((,.(((((.((.....}}.)))))..))..))))}.}))))}}))}}}((((((((...(((((((...((((((..(((......,,,,,,....)),..........(((({..,((.,(((((.(((((...{..,,,.,,(((((.,,,{,....|,|||..((((((.((((.,,,,...,{,{{{,|||......{(((((((.(((.....)))..}))))))}.........{{.((((..........)))).}}.........,,,..,}|}},.....{{{{{...,}})).......(((((((((.(((((((((...(((((..,.((((.{((((((((((({.{{.,,..,},}}).)))))))))}((((((((,.{,(((((((((....((((....)))).(((((.((((.,,((({,,{....,,((((.(((.(((((((((((((((((...))))))))}.,{((((......}}})},..((((((((....,,((((..{...((((((((..((((.{,....,}.))))..)))))))).,.....))))})))))))),)))))))).))).)))),..,,,.)))}..,,)))).)))))....{(({...}))).........))))))))).,}.))))))))(((((.((({.......(((((((((((((((((((((((..((((((.((.(((((....((((((({,(((((((...((.....{((,....,,,.....,....,,((((((......))))))..|,,|||.((((((((((.{{{{{((((..{(((((,{(({{..(((((((.....))))))),}{||..}}}}}}..))))....,,(({{.....,})}}.....{((((.((.(..(((((.((({.......))|}).)))))..))).))))}.(((((..,.((((((,{((....))}(((((((.((((........,,.((((.(((({(((......))))))).))))..{.{(.(((((......))))).))..}},,.......,.}))))))})))))).,..))))).{{,.,|,,|}}}}}}},,,......})}))))))}}}}....,..{((((((.((((......)))).)))).))})))))))))).||},..,,}...}))..)))))))))))).))).,,,,......,.(((((....}}}|}......,}}.....{||....),,.(((((.((((,......{(...,(((({..,...}}}.},|,||..(((.....,}))........((((.(({((((((((...(((((((......)))),,))......)))))))).))).)))).((((....)))).,,..........{{||,|||.......))).}))).}.))))))))))))))))))))))..{{{(((((((..(((((({...}))))))..))))))).|||}.{,....))))))))))||,...,|,|....,.,,)))))))))))))))...(((...............)))...}))).)))))..{{,{{(((.(({,.,,|{,||...||,..(((((..........)))))..,|,..|||,,}|,((((({....}))))).....{((.(((((({.((((((.,.((,..{(((((((((...{{,.....,}}..)))))))))))).,)))}})).}))))))))}|.}})}.)))))))..)))).})))))))))))))).)))))))))....}))))))))).....)))))},},,))))).))))).}.))))))).)))..))))))....)))))))...))))))))..},|||...,,.|||}..,{(((.(((((.....))))).)))}))))).)))).,})))|(((((..((((((((((...))))),}))))..)))))}..,,,,,,.(((({.(((........))).)))))..||{{.....,,})})))))))))))))})))))),..(((((((.....,((((,....,,))},,,.))))))))))))))...)).))))))))),..))}),,,,)))..}})))))).))))))......((((((((((........)))))))))).)))))))))},..))))))))..)))))))).},))),...,,,{{{,{{|{,...(((((..,({({,...,,},}}}...))))),...}}))))||((((((((,..(((........)))...))))))))},.)))))))))..(((((((.(((........)))))))))))))}},.,........,,,,.....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCUGCCGCCGCCGCUAACCGAGGGAGAGCUGCGAGCGAGCACCCAGGCC… 3805 nt 0.4124
Summary

Enables miRNA binding activity. Involved in miRNA processing. Acts upstream of with a positive effect on post-transcriptional regulation of gene expression. Predicted to be located in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.