Basic Information

Symbol
ZCCHC11
RNA class
mRNA
Alias
Terminal Uridylyl Transferase 4 KIAA0191 ZCCHC11 TENT3A PAPD3 Zinc Finger CCHC Domain-Containing Protein 11 Zinc Finger CCHC-Type Containing 11 Terminal Uridylyltransferase 4 TUTase 4 Zinc Finger, CCHC Domain Containing 11 PAP Associated Domain Containing 3 EC 2.7.7.52 TUTase4
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001009881.3
Sequence length
5853.0 nt
GC content
0.4027

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1496.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1610.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1463.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((......))))))((((((((((..(((((..((.......((((.((((((.((.((.((.((.......)).)).)).)).)))))).).)))))..))))).)))))).......(((((.(((((.((.......)).))))))))))....(((((((((....(((.(((((((((........(((((((((((.(((...((((.((((.((.....((((........((((((((........(((.((.....)))))......)))))))).............((((....(((((.......)))))...))))........(((..((((...))))..)))............)))).....)).))))))))))).)))))..........))))))...........(((..((..(((((.((((((...(((....)))...)).))))))))).))..))).((((..(((((((.....)))))))))))....))))))).))..)))....)).)))))))....((((((........)).))))(((.....)))..))))...((((((((((((((..........((((.((((((.(((((.(((((((((.......((((........))))..((.......)).............((((((((.((...((((((((((..((((((.(((..((((((.(((((((((((.(((((...........))))).))))..............((((((......))))))((((((((((((.((....)))))))))....(((((((.(((((((((.......((((((((((....(((((((((((.(..(((((((....((((.((((((..(((((((((((.((((.((..((((((.....(((.(((.((((.((.((((((((...((((((((...................)))))))).........))))))))...))))...............(((((.(((.(((((.(((....))).))).))...)))))))).)))))))).((((((.......))))))..))))))..)).)))).)))))).))))))))))).))))(((((.....((((((.((((((.............(((((((...............(((((...................(((((......))))).....(((.((..........)))))))))))))))))......(((((((..........))))))).))))))))))))....))))).....((((.(((((((..(.((.((...((((((((.(((.(((((((((............))))))))).))).))).))).))..)))).)..)).)))))))))((((..(((......)))..)))).((((.((((((..............(((((((.((.......((((...)))).......))))))))).............)))))))))).(((.(((((((......))))))))))......)))))))......).))))))......)))))....)))))))))).(((((.((.....((((((((((......((((((.........((((...)))).((((((.......))))))...((((((.((((.....))))(((((..(((((((((........(((((...((((.(((((.........((((((((.......)))))))).(((((((((.....)))))))))..((....(((((..(....)..)))))..))..((((((((.....(((.......)))........(((((((..((.......((((((...((((((((((((((((...)))).......((((.((((.....)))).))))(((((........(((((((.(((............((....))............................(((((((.........)))))))..))).)))))))...(((.((.((.....)))).)))(((((.(((((...(((((((...(((..((((((((((...(((.((.((....)).))...)))...)))))).))))..)))...))))))).............))))).)))))..(((.....)))((((((((....))))))))...(((((.((((((...(((((.(..((((((.(((((((((((....((((((((.((.....((((.(((....(.(((.((((...(((((.((((....(((((......)))))(((((((............(((((((((......((((.((((.......((((((((((.......((((((...)))))).(((((..(((.....))))))))........((((((((((((....(((((((..(((((((............)))))))(((((.(((((((..((((((....))))))...)))))..)).))))).........)))))))........)))))))))....)))..((((((......(((((....(((((((((....(((.((......)).)))......))))))))).....).)))).((((((((((((((((.(((((((((..(((....)))..)))))))))...(((((((((((.....(((....(((((((.((((((((.(((((((((((((......))))....(((.....((((....)))))))..((((((...)))))).((((((((((..((......(((.......))).........((((((((((((.((((((..(((.((((((((((((((.((....)).(((((...)))))....)).))))(((((...))))).))))).(((((.(((((((........))))))))))))...............(((....)))...(((((......))))).....))).)))..))))))))))))...(((((((.((.....)).)))))))..(((((((((...(((((((...(((((((((.....)))))........(((((((((.((.(((((((((.((((.(((((((..(((((((((.(......).))))))))).(((((((...(.(((....))).)...))))))).(((((.((((((......))))))...))))).......))))))).))))...))))))..)))..)))))))))))..))))....))))...))).....)))))))))))))))..(.((((((((..(((.((....(((((((........(((((((..(((((....(((....(((.((.......)))))..)))((((((((........))))))))...........))))).))).))))(((((.((((((((((((((((...))))))..))))))).))))))))..((....))(((((((.....)))))))((((((((..((..((((((((..(((.....)))((((((.(((((......))))))))))).)))..)))))..))...)))))))).((((......)))).)))))))....)).))))))..))))).)........))..))))))))))..))))))).))))))).))).)))))))...)))..)))))).)))))......)))))))).))))).))).......))))))......((((((...((((((.(((....))).))))))..)))))).....))))))))))........)))).))))(((((((((.((.(((((.(...(((((...))))))))))).)).......)))))))))......))))))))))))))))......((((((((.......))))))))..((((..((....))...))))...(((((((((..((.((.(((((((((((((.((((.........))))))))))....((((((((...)))....)))))(((((((((..............))))))))).............((((((.............)))))).......(((((.....))))).((((((.(((...((((((((.(((...........)))))).))))).)))))))))..))..))))).))))..)))))...)))).(((((...))))))))).)))))...)))).))).)))).))))..))..)))))))).))))))))......))).))))))..).))))).)))))).((((((.(((((....))))).........(((((....))))))))))).........)))))..))))).)))))).)))))).))))))))..))))))).........)))))))).....((((((.............)))))))))))))))..)))))....((((.......))))............)))))))))..)))))....)))))).))))))......))))).).))))(((((((.(((....))).......(((....)))....(((((((.(((....))).)))).)))((((((((((.(((((.((((..((((.....)))).....(((((......)))))....)))).))))).)).))))...)))))))))))......((((......))))......)).)))))..(((((..(((((((((.(..((....))..).)))))))))..)))))(((..((.(((((.....))))).))..)))((((...((((...)))).))))))))))))).....)))))))((..((((.((((.(((((.........)))))...(((.....)))............((((..(((((((((((...(((.(.((...)).).))))))))))))))..))))........)))).))))..)).....)))))..)).).)))).))))))))).))))))..))..(((.(((((...((((.......))))((((((((...(((((.....(((((((.((...(((....))).)).)))))))..)))))((((((((((((((((...))))))).............((..((((((((((.........)))).))))))..))((((((((...(((((((....))))))).))))))))......(((((((((...)).)))))))....................((((.......))))........)))))))))..)))))).)).....((((((((.((((((...))))).).)))))))).........)))))...)))...)))).)))))).))))))))......(((((((...))))))).(((((((((((((((((..(((.((((.(..((((....))))....).)))).)))..(((((....)))))............))))))....))))).)))))).))))))))).))))).....)))))).))))..((((((....)))))).....))))))))))))))((((((((((....))))))))))...........((((((....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((......)))))),{,,((((((..(((((..((.......((((.((((((.((.((.((.((.....}.)).)).)).)).)))))).).)))))..))))).)))))),{{{{..(((((.(((((.((.......)).)))))))))).,.,(((({((((,,,,(((,(((((((((....,,..,{{{,(((((({(((...((((.{(((......}}||||},....}}||||||||.....{{{{,{.{|,,....,|||.....{|||,,,))}}...........,,,{{{,.{((((.......)))}},},))))..}}}.}}|}|},,||},}.,}},..,}}...,|||,,...}}}}.....,,..,}||||.,,},))}}|,....||,...|||||,..........(((,..{,,{.{||||.,.......||},,.))}...},.}}}..,,,...})))||.{(((..(((((((.....))))))))))).},.}))))}).)}..}))..,,}},,,)))),....,{{{{{...,....||,}}}.(((.....)))..,)))}},((((((((((((({..........((((.((((((.(((((.(((((((((.......((((........))))..{{.......}}...,,{,......((((((((.({...{(((((((((..((((((.(((..((((((.((((.{.(((({(({({....{{{{{{.,||||.||||{{,,.......{{.((((((......)))))).||,,,,||||}}}}}{{,{,,.,,,,....,(((((((.(((((((((....,{,{(((((((.....(((((({{{.{{|{,,(({{{{,...,{(((.((((((..(((((((((((.((((.((..((((((..{{(((({.(({{{,..{..(((((((....{(((((((......{{{.....,,,..))))))||.{{.{{{.,,,,,,,,.....}))}}}.|},.,,.....(((((.(((.(((((.(((....))).)))},)...)))))))).....}))},||.,|,}}).}).))))))}}))))))..)).)))).)))))).))))))))))).)))|(((((.....{((((,,((((((....,,.......(((((((,.............,{((((...................(((((......)))))....,({({((,,,|.||,||||||||}}}}}}}}}})......(((((((..........))))))).})))))))))}},...|}}}}|,,..((((.(((((((..(.((.((...,{(({(((.(((.(((((((((............))))))))).))).))).))).},..)))).}..)).))))))))),,{{..,{{|||||,},,..}})}.|,{|{{(((({,,{,{.........(((((((,(.....{{.((((...))))}}....,).))))))).........,...)))))))}}}.{((.(((((((......)))))))))}..}}},)})))))))))})))))),.)},..,,{{|}},}}}))}{|{((({(,(({((({...,((({{.,.|}|}}....,,||||,,,,,,,..((((...)))).,{{{{{.....,.}}},}}...,(((((.,(((.....)))|(((((..(((((((((.....,{.((({{...((((.(((((.........((((((((.......)))))))).(((((((((.....))))))))).....,..(((((..{....}..)))))..}|{.((((((((..{..(((.......)))........(((((((..((.......((((((...(((((((((((({{{{...,}}).......{{{{.((((.....)))).})}|(((((....{{{{((,,((((((..((((((...,,(,...(((((......................,,..(((((((.........)))))))....|{|.,,.,,...}||.,,,((.....}))).,,)))))..|,}}}.))))).}..)))))}{{((((,.......)))}}}.}}|}}}.,{{{{.{({({...(((((....))))),}))))}}}..,................|.{{{{...,|||.,...}}}((((((((....})))))))...{{{{{.((((((...(((((.{..((((((.(((((((((((....((((((((.{{.....((((.(((....(.(((.((((.,,(((((.((((..{{(((((...,,{||||,,,|||||},..........(((((((((......{(((.{(((.......((((((((({.......((((((...)))))).(((((..(((.....)))))))}........,{,(((((((((,.,.(((((((..{((((((.,.......,{,||||}},,,|||,||{((((..((((({....})))))...}}}}}..,}.}})}},,|,.....)))))))....},..))))))))).{{{||.,{{({,{{......((((({{..{{{,(((,,,,,,....(({{....{|{|||{.....||||||},,.....|,||||,((((((((({(((({|.(((((((((..(((....)))..)))))))))..{((((,{{((((...}}||,..,,|||{{{{.((({(({{.{,,((({{(((((......))))))}}|,......{{|{....))}||||,.((((((...)))))).{{{{{{{{((,,(({{,,{{{|,,.....,)),,,|,||||||{{{{{|||||{|{||.,,,,,,((((((((((((((((.((....)).(((((...)))))....)).))))(((((...))))).)))))}))))).,,||||{,.{{{{.,|||{{{{{.{{{...............(((....)))...(((((......))))).....))).)))}}))||}}}}}))}.,.(((((((.((.....)).))))))).,{{{{{{{{,,|,|||{{||...{{{{(((((.....)))))........((((((({{,{{,(({{{((((.((((,(((((({..(((((((((.(......).)))))})}}.({(((((..,{.(((..,,})).,...))})}}}....{,.((((((......))))))...,,}}},,,....}||||||,}}}}...}}}}}|,|))),,}}})))))))}.,||||,,,,||},.,{|||.....},,,,}}}}..}}},})),.|})})}}},}}))))}..}}}|||}}.}|},....{|||||}}.......,.,......||(|((,.,....)|))),,,,.{{((((((........))))))}}{{{{{.....)))))||{|,,,))}|{{((.{{|{((((({((((((...)))))}..))))))).))))))))}}}}|...|||||||||||||||}}}}}}|||,,|||,.,|||||,,,{|,,{(({.{{{,.,.((((((.(((((......))))))))))).,,,,|||,||,,||(((((((((((((,(......,.))))))}..,,..,))))))}.)).})})))),..,)}}}})},.)))))))))).,))))),)))))}|||.|||,|}}}}},.,,})},|)))}}}.||}||,,....||||}}}},})))|{|||{{.....,)))))}},,..||||||,..((((((.(((....))).))))))..,}}}}}.....})))))))))........)))).)))}((({{{{||,,...,{{{.,...(((({...}}}}}.,,}}},}|,,,,|||}}}}})))),,,,,.))))))))),))))))}.....((((((((.......)))))))).,((((..{{....}}...)))),..(((((((((..{(.((.((((,.,((((((.((((.........))))))))))...{((((((((...)))....)))))|((((((((...{{.....,}..)))))))),..,,{({,,....((((((.............))))))....,.))))).....,||,,,.((((((,{((...(((((,({.(((........,..))),}}.))))).)))))))))..,},,))))).)))}..)))))...)))).(((({...})))))))).))))).,,)))).))).)))).)))).,}}..)))))))).))))))))......))).))))))..}.))))).)))))).(((((({(((((....))))).},.,.,,.(((((....)))))}))))).........)))))..))))).))))))}}))))).))))))))..))))))).........)))))))),,...((((((.............)))))))))))))))..))))}......||.,,,,,,,|||...,,.},,...)))))))))..))))),...)))))},}}}}}},..{((((((.....}))}}}|,,|}|{|,...))),..,,,,|{|....}})},..{{{|{||.{,,....,||.||||{|,|{({,{{|(((.(((((.((((..((({.....}))).....{((((......)))))....)))).))))).))},|||,.,{|||,,...,,...}},|||}...}})))))}})))}},,,,.,},|(((((..(((((((((.{..((....))..).)))))))))..))))){((..((.(((((.....))))).))..))}((((...{(((...)))).))))))))))))).,...)))))))|,,{((,..,|||,{((((.,.....,.))))},,.(((.....)))}},.........,,,{{((((((((((((...(((.(.{{...,,.}.)))))))))))))).))))),,......,}|,.},))..,)}}}}}),)))},,},).)))).))))))))).))))))..}}.,,{{.(((((,..{{{{......,))))|,{{{{((,,.(((((.....(((((((.((...(((....))).)).)))))))..)))))((((((((((((((((...))))))}.............((..((((((((((.........)))).))))))..)){(((((((...(((((((....))))))).)))))))}......((((((((,...,).)))))))..................,.((((.......)))),,,....})))))))))..)))))}.||,....{{((((((,(((({(,..,}})).,.))))))}),,,,,.,..})))}.,,)}}.,,))))}}))))).))))))))...,,,(((((({...})))))).((((((((((((({{{,..{((.((((.,..((((....))))....}.)))).))}..{{(((....}})})............,,,,,,.,,.)))))))))))).))))))))).))))),,...}})))).))))..((((((....)))))).....}))))))))))))){(((((((((....)))))))))}.......,,,.,{{{{{....))))}.
Summary

Enables RNA uridylyltransferase activity. Involved in RNA metabolic process; stem cell population maintenance; and transposable element silencing by mRNA destabilization. Located in cytoplasmic ribonucleoprotein granule; cytosol; and nucleolus. Implicated in liver benign neoplasm. Biomarker of breast cancer. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.