Basic Information

Symbol
ZCCHC12
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger CCHC-Type Containing 12 SIZN1 PNMA7A SIZN Zinc Finger CCHC Domain-Containing Protein 12 Paraneoplastic Ma Antigen Family Member 7A Smad-Interacting Zinc Finger Protein 1 FLJ16123 Zinc Finger, CCHC Domain Containing 12
Location (GRCh38)
X:118823824-118826968
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173798.4
Sequence length
2197.0 nt
GC content
0.5075

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-772.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -812.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 544.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001312891.2 NCBI
GGCGCUGCCUCGUCUCUGCUACCCCUGGUUGGGCGGCCCUGCGAAGCAG… 2145 nt 0.5077
NM_173798.4 NCBI
GGCGCUGCCUCGUCUCUGCUACCCCUGGUUGGGCGGCCCUGCGAAGCAG… 2197 nt 0.5075
Summary

This gene encodes a downstream effector of bone morphogenetic protein (BMP) signalling. This protein contains a zinc finger domain and functions as a transcriptional coactivator. Variation in this gene may be associated with X-linked cognitive disability. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

The review of proteomic applications in forensic science identifies the ZCCHC12 as a protein marker showing loss post-mortem in bone, contributing to the estimation of the late post-mortem interval [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].