Basic Information

Symbol
ZFR2
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger RNA Binding Protein 2 KIAA1086 Zinc Finger RNA-Binding Protein 2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_015174.2
Sequence length
4766.0 nt
GC content
0.6370

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2084.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2163.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1228.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((((((((((...))))).((((((........))).)))((((((((((((((((((......))((((((((...((.((((..(((((....(((((((((.(((....(((.........((((((((.(((...((((((((.((((.(((.................))).))))..((((((..((.(((.......)))..))..)))))))))))))))))..))))))))...(((((.((((((.((..(((((((.(((....((.(((((...(((((.....)).)))))))))))))))))))).))...))))))...........((((.((...(((((((((........))).))))))..)).))))..))))).......(((((.((((......)))).)).))).....)))....)))..))))))))))))))(((((.....((((..(((.(((....(((((((((((..((((((((((((((.......((((((.(((.....)))...)))))).((((.((.(((((((((((.(((((((((.((((.................(((.....))).......(((((((.(........))))).)))(((((((((((((((......((((((.((.(((...((((((((.((((((((.(((.(((...((((.(((((.(((.(((.((((((....((((((..(((((((((((.((((((((....)))))(((((.(((((((..(.(((......))).)..))))))).(((((...((..((((.....))))))...))))).)))))(((((((((((...)))....)))))).))((....))...........))).))))))........((((((((((....(((..((..((((((.((((((((((((.....))))).))))))).))))))...)).)))((((.(.((....))).))))......(((((((............)))))))..))))))))))....)))))..))...)))).......(((.(((((((.((.((((...(((((...))))).((((((..((((...((((((((((((..((((.(((.(((((......(((((....))))).........(((((.(((.(((((((......)))))))..)))))))))))))))).))))..)...)))))))))))...........(((.......)))(((.(.((((((((.((......(((((....).))))(((((.((((((.(....).)))))).))))).(((.......))).)))))))))).).)))...))))..).)))))((.......))...)))))).))))))).))).....((((......)))).)))))).))).)))))))).))))((((((((.((.(((......((((.....(((...)))))))....))).))...))))))))))))))..)))))))).)))).((........)).))))...)))))))))))(((((((...))))))))).))))))).)))))))))))))))..)).)))))))((......)).((((......))))(((((((((.....(((((((....))...))))).(((.(((((....((....))....))))).))))))))))))(((((((((....)))).)))))..)))))))).))))....((((((((.......(((((((.(((....(((.(((((..(..((.((((((((((((((.((((((((..((((((((.....)))))))).)))......(((((((..((((.((..(.(((((((..((......))))))))))))...))))))))))).....((((((((......)))...)))))...))))).)).)))))).))))))))..).)))))...)))..))))))))))(((..(((...(..((((.(((((.((.......)))))))))))..).)))..))).)))))))).....(.((.(((.(((((.(((((((.((((((.................((((((((((.((((...(((..((((((......))))))..)))...))))..))))))))))...((....))...)))).)))))))))))))).))).)).)))))).)))))))))...))))..))).)))).....))).)))..))))(((((((...((((((.(((((.((......))))))).)))))))))))))......((((((((....))))).))).((((((((..((((((((.(((((((((((.(((((.(..(((((.((..(((((.(..(((((((((((....((((((((....((((...((((((((.(.((((.((.(((((((((.((.((((.(((((....))))).......)))))).))))))))))))))))(((((((.((((..(((((((((((((.................((((..(....)..))))..((.....))..((..(((...((((((((((((....((((.....))))((((((..((....))....)))))).....(((((((((...(((((.....)))))...((((.(((..(((((((((((((...(((((((.......((((((((.(((((..((((((((((((....))))).)))..))))....))))).)))).)))).))))))).)))))((.(((....))))).......((.((((.(.((((....((((((.....(((((((((((((((((.(((......((((((.((((.......(((.....)))...((((.(((.((((((.(((((...((((((....))))))(((((.((..(((((((......))))))))))))))..(((.((((.((((.(((.((((.....................(((((((......))))))).(((((((((((.((((.((....)))))))).))(((..(((.((((.((((.(((.((.(.((((....)))).).))..).)).)))))))).(((.(((...))).)))))).))).................))))))))))).))).).))))))).)))((((....)))))))))))))))))).))))...(.(((((..((.((((.((.(((....))).))..))))))..))))).)....)))).))))))))).)))))))))(((((((....)))))))((((.......).))).))))))))....))))))...))))).)))).)))))))))).)))))))...)))).))))).)))))))))))).....))).))..........)))))))))))))..))))))))...)))(((....)))...((..(((((...........((((((((((((((((((.(((((...........((((((....)))))))))))....((((((....((((((((....))))))))..((((((.(((.....((((......))))..............((((....))))((((..((((.....((((........))))))))..))))((((....((((((((......)))))))))))).....))).))))))((((.((((((((......))))).)))))))((.((.((((.((((((((..............................)))))))))))).))))((..((((((((...)))).)))).)).((((((.....)))))))))))))))))))......))))))))))))).)))..)).))))))))..))))...)))))))))))))...)))).)).)))))))).)))))..)))))).))...)))))))))((((...))))...((((((((......))))))))))))))))))))))))..)))))..)))).))..))))))))((((((((((....(((((.....)))))....))))..(((....))).((((((..(((.....(.((((.((((((((((((.(((((..((((.....))))...)))))((((..(.((((((((((((((.(((.(((........................)))...))).)))))))))).)))).)...))))(((((........)))))...))))).))))))).)))).)..)))..))))))....))))))))))))))))))))))...((((((((.((((((((((.(((....))).....(((..((((((((............)))))))).))).))))).........)))))))))))))....))))))))))))..(((((((((((.(((..........)))))))...)))))))..(((((.(((((((...))))....(((((((((((((.(((.((...(((.......(((((((((.(...........)))))))))))))....)).))).))).))))))))))))).))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((.(((({,,{.(((({...})))).{(((((........)))}|||((((((((((,(((,(((......))|,,,,|||.}}|..,|,{{{{{{{({,.,,(({((||{.,((....,,)}.,..{{{{,,,,||||.|||.}}||||{|||,.}|}||||,,{{{(((.{{((,,,}}}}.)))}..(((((...,,..,,)}}},((((((((({{{{({{{{..(({{{|.{{{||||||||...{|||..((((((.,(..(((((((.(((....((.(((((...(((((.....)).)))))))))))))))))))).))...)))))).......}}}.||||||,...(((((((((........))).))))))..||{..|{{{||{{{.......{{{((.((((......)))).}}{|||.{{,...}|||,}}}..||||}}.,,},,))}||,,...,}}|.|...{|,|.|}}|.(((((((((((..((((((((((((((.......((((((.(((.....)))...)))))).((((.((.(((((((((((.((,,((((((((((...........,{{,{{({{....,|}}.....,.,{{{{{..{......,.)))))})))(((((((((((((((......((((((,((.({(,,.((((((((.((((((((.{{(,(((,{,(({{.(((((,(((.(((,(((((({{{,(({{((..(((({((((((.((((((((....)))))..,{{.(((((((..(.(((.....,))}.}..))))))).,.||{,,..,.,(({(.,.,,|||,.,..,|||||.}|||,(((((((((({...)))....)))))).))|))),.)).,,,.......))).))))))........((((((((((....(((,.{{,,((((((.((((((((((((.....})))).))))))).)))))},,,}}.}}|((({,{.(({...,))}}})).....,||||.,|,,{{.{{{....))))))...))))))))))....})||}..}}...))))...,,|.|||}|||||{{}||{((({...(((((...))))).({(((,..|||{...(((((((((((,..((((.(((.{((((......(((({....))))).........(((({{(((.(((((((......))))))).,})))))))))))}))).))))..}...))))))))))).....{(((..,((,...,,,.)))|{,,.((((,(((.,,..,}}.,||||...,},,}}}(((((.((((((.(....).)))))).))))),{||.....,,|||.||||||||||.|{,,,...}})),,),)))))||}}}},}.}}...)))))},}||||||.|||..,{.({{,...,,,,})),})))))}))).)))))))),))}},|||||||.|{.{{({..,.........|}|||||||||........,||{{{,,.}},,}})))))))),,)))))))).)))},((..,.....}).)))},..)))))))}))}{{{{|{|,..))))))))).))))))).)))))))))))))))..))}))))),}((......)).((((......))))(((((((((.,,{{(((((((....)),..,)))).(((.(({{,...,||},...),...,}})),),,)))))))))(((((((((....)))).)))))..)))))))).)))).,{.((((((((.......(((((({{(((....(((.(((((..(..((.((((((((((((((.((((((((..((((((((.....)))))))).}}}}||,..(((((({.{((((.{{..{.(((((,{.,(({{....)))))))))))}...))))))))))).....((((((((......))),..)))))...})))).))}}))))))))))))))..).)))))...)))..))))))))))|((..(((...(,.{(({{(((((.((.....,.))))))))))),.,.)))..))).))))))))..,,.(.((.(((.(((((.(((((((,{(((((..,.......,|.....((((((((((.((((...(((.,((((((......)))))},,)))...))))..))))))))))....,.....,...)))).)))))))))))))).))).)).)))))).)))))))))...))))..)))}}))).}}}}))))),)}}|.,|(((((((...((((((.(((((.((......))))))).))))))))))))},,....((((((((....))))).))).((((((((..((((((((.(((((((((((.((((({(..(((((.((..(((((.(..(((((((((((,...((((((((....((((...((((((((.(.((((.({,(((((((((.((.((((.(((({....})))).......)))))).)))))))))))))))}(((((((.((((.,(((((((((((((.....{.,,,,,,..|.(({(,.,....|..}}||,.((|....}},}||.,(((...((((((((((((,,,.((((.....))))((((((..((....}}..,,)))))).....{({((((((...(((((.....)))))...((((.(((..((((((((,(({{{{,(((((((.......((((((((.((((({.((((((((((((....))))).)))..)))).}}.))))).))))))})).))))))).|}}}},,.,{,||||}})))..,,...{{.((((.{.((((,{..((((((.....(((((((((((((((((.{((,((({{(((({,..........,|||{,((({|{,,..{(((,(((,((((((.((((,...((((({....})))))|||||,||..(((((((......)))))))))))))|,.(((.{(((.((((.{{{,((((,,,...........,......{{,,(((..,{..|||||||{((((((({{((,...||,|}||||..,||}||}|,{{,||.,,||||}}|||}||{.,.,|)})||..}})})).},},..|||||}}}))))).{{{.{(|,..})),}))},,.}||.............,,,,)}}|))}}})).}}}.}.))))))).}||((({....}))))))))))})))))),))))}},||((|||..((,((((.((.(((....))).))..)))))).,))))),).,}}||,|..,,},,))).))))))))){((((((....))))))|((((.......),,)).))))))))....))))))...))))).)))),)})))))))).)))))))..,)))).}}))).)))))))))))).....}},.)),,........))))))))))))).,))))))))...)))(((....)))...((..(((({...........((((((((((((((((((((({,,..}}}}.....((((({....}))))){((,,.}},{(({({.(((((,,.(((((({((((...}}}}.|.)))))).....||}|}..}}}}|||.{{{{.........{(({....))))((((,.{(((,{{,{(({{.,,..|,.||,}}))),.)))|}}}||||.{(({({{{.,,,}.))))}})|||{||||..||}|}},,,}|(((.((((((|(,,...}))))).)))))))|{{(...|||}((((((({..............................})))))))},}},))))})})},||{{{{...,})).}|})|}}.((((((.....))))))})))))}))))))}.....,)))))))))))}.)))..)).))))))))..))))...)))))))))))))...)))).)).,))))))).)))))..)))))).))...)))))))))((((...))))...((((((((......))))))))))))))))))))))))..))))),.}})).))))))))))|{((((((((((...{(((,({{.{{{{{.|{{{{|.,{({((({{{{|||.((((({{{(,({{{{{(.((((.((((((((((((.(((((..((((.....)))}...))))){(((..{.((((((((((((((.(((.(((........................)))...))).)))))))))).)))).,.,.))))(((((........)))))...))))),,)))))).)))).,..}}}..,)))))...,)))},)))}|||||||||,}})}|,|{{||{{{.{{{(({{(({.(((....))).,.,.(((..((((((((..........,.)))))))).))).}}}}},,...,...,,||||||||||,.....,,,,,))))))},(((((((((((,,((.........,})}))))...)))))))..,,{,,.||||{||,,,)))},,,.,,(((((,(({{,.{{,}||}}}}|}}}}.,.}|,|||||||}}}}}.}})))..))),)))),))))).....})))})),))))))},}}|}},.,,,,}.....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGGCUCGGGGAAGACGCCAAGAUGGCGACGAGUCAGUAUUUCGACUUCG… 884 nt 0.5905
AGGCUCGGGGAAGACGCCAAGAUGGCGACGAGUCAGUAUUUCGACUUCG… 4766 nt 0.6370
Summary

Predicted to enable double-stranded RNA binding activity and single-stranded RNA binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ZFR2 is a Lrap-influenced transcript whose expression is positively correlated with alcohol consumption and negatively correlated with Lrap expression, with its sum of isoforms significantly increased in the brains of Lrap knockout rats [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698].