Basic Information

Symbol
ZFY
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein Y-Linked ZNF911 Zinc Finger Y-Chromosomal Protein
Location (GRCh38)
Y:2935281-2982512
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003411.4
Sequence length
5336.0 nt
GC content
0.3771

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1431.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1540.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1316.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145275.2 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 5094 nt 0.3746
NM_001145276.2 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 4440 nt 0.3480
NM_001369702.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 5013 nt 0.3559
NM_001369703.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 5247 nt 0.3770
NM_001369704.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 4924 nt 0.3554
NM_001369705.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 5113 nt 0.3695
NM_001369706.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 5183 nt 0.3747
NM_001369707.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 4860 nt 0.3527
NM_001369708.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 4771 nt 0.3521
NM_001369709.1 NCBI
AGUGCUCCAGAGAAAGGCCGUCCUGCAGCACCCGCCGCUGUCGCCGACC… 4287 nt 0.3441
Showing 1 to 10 of 12 entries
Summary

This gene encodes a zinc finger-containing protein that may function as a transcription factor. This gene was once a candidate gene for the testis-determining factor (TDF) and was erroneously referred to as TDF. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the ZFY was one of 16 overlapping transcripts identified by both LASSO and XGBoost machine learning models as important for the early prediction of multiple organ failure from blood transcriptome data collected within 24 hours of injury [Duran et al. DOI:10.1186/s13613-024-01364-5].