Basic Information

Symbol
ZNF107
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 107 ZFD25 Zinc Finger Protein 588 Smap-7 ZNF588 C2H2 Type Zinc-Finger Protein Zinc Finger Protein 107 (Y8) Zinc Finger Protein (ZFD25) Zinc Finger Protein ZFD25 Y8
Location (GRCh38)
7:64666099-64711577
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001282359.2
Sequence length
5630.0 nt
GC content
0.3458

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1187.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1303.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1512.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001013746.3 NCBI
GCCUUUGUCUCUGGCUGCAGCCGGAGCUCCUGCUCUCCUCCUCACUGCU… 5790 nt 0.3518
NM_001282359.2 NCBI
GCCUUUGUCUCUGGCUGCAGCCGGAGCUCCUGCUCUCCUCCUCACUGCU… 5630 nt 0.3458
NM_001282360.2 NCBI
GCCUUUGUCUCUGGCUGCAGCCGGAGCUCCUGCUCUCCUCCUCACUGCU… 5534 nt 0.3442
NM_001388025.1 NCBI
GCCUUUGUCUCUGGCUGCAGCCGGAGCUCCUGCUCUCCUCCUCACUGCU… 5899 nt 0.3545
NM_001388026.1 NCBI
GCCUUUGUCUCUGGCUGCAGCCGGAGCUCCUGCUCUCCUCCUCACUGCU… 5772 nt 0.3517
NM_016220.5 NCBI
GCCUUUGUCUCUGGCUGCAGCCGGAGCUCCUGCUCUCCUCCUCACUGCU… 6059 nt 0.3600
Summary

This gene encodes a protein containing multiple C2H2-type zinc finger regions. Proteins containing zinc fingers may act as transcriptional regulators, but may also have other cellular functions. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

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