Basic Information

Symbol
BST2
RNA class
mRNA
Alias
Bone Marrow Stromal Cell Antigen 2 Tetherin BST-2 HM1.24 CD317 Bone Marrow Stromal Antigen 2 Antiviral Factor Tetherin HM1.24 Antigen CD317 Antigen NPC-A-7
Location (GRCh38)
19:17402933-17405665
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004335.4
Sequence length
1001.0 nt
GC content
0.5734

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-407.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -425.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((....(((((((((((((((.....)))).)))))..((((..(((((.(((.......))).)))))(((.((.....))))).....((((((..((((.((.(((((((((.......((((((((((((((...)))))..))))))))).....))))))))).))...))))..)))))).....)))).((.(((((((...((((.(((((.(((.(.....).))))))))..))))...))).)))).))((((((.(..((((((.(((.(.(((((..((..(((......)))))..))))).).))).))))))..))))))))))))).((((((((((((((..(((((.((..((((.(((((((((.((...................)).))))))))....(((.(((((....)))))))).(((............))).((((...(((((...)))))...))))....(((((((.((((((...(((.((((..(((((.(((...(((((.((.......)).)))))))).)))))....)))).)))(((((.((((....))))...)))))((((((.(((.......)))))))))...........(((.((((((..(((....)))..)))))).)))(((((...))).))..)).))))..)))))))((((((..((((.(((((((.......(((((((((.((((..((.(((((.((((....)))).)))))))..)))).)))).))))))))))))))))..)))))).......((((((((.((.((.((((((((.......)))..))))).)))).).))))))).).))))..)).))))).)))))))))))))))))))))).))).......))))))))))..((((..............(((((...)))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((((((....(((((((((((((((.....)))).))))).,((({.,{{(((.(((.......))).)))))||{,|{,....|||||.....((((((..((((.((.(((((((((....,..((((((((((((({...}))))..)))))))))...,,))))))))}.))...))))..)))))).}}}})}))|((.(((((((...((((.(((((.(((.(,...,).))))))))..))))...))).)))).))(((({{{(..((((((.(((.(.(((((..((..(((......)))))..))))).).))).))))))..))))))))))))).((((((((((((((..(((((.((..((({..((((((((.((..............,,...)).)))))))),{,.(({,(((((.,,,||||||||.{({{{,.........,.,.||||...(((({...))))).,,,,},....{{{{{((,((((({.((((((((((..(((((.((,,,{(((((.((.......)).)))))))).)))))....))))..,,))).}}}..|||||)))),...}}}}||,,},})))}}})}|,|||||||{({({.,,.,..{(((.((((((..(((....)))..)))))).))))......,}}}))))})),)))).,)))}}}|((((((..((({{(((((((.......(((({((((.((((..((.(((((.((((....)))).)))))))..)))).)))).})))))))))))))))..)))))).,.....({((((((.{((((.((((((((.......)))..))))).)))).).))))))).},))))..)).))))).))))))))))))))))))))))},)),......}))))))))},.{(({,............,{((({...,)))))}})........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004335.4 NCBI
GAAGAUUCCAGCACCCUCCCCUAACUCCAGGCCAGACUCUAAAGGGGAG… 1001 nt 0.5734
Summary

Bone marrow stromal cells are involved in the growth and development of B-cells. The specific function of the protein encoded by the bone marrow stromal cell antigen 2 is undetermined; however, this protein may play a role in pre-B-cell growth and in rheumatoid arthritis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.