Basic Information

Symbol
ZNF292
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 292 BA393I2.3 KIAA0530 ZFP292 Zn-15 Zn-16 Putative Protein Product Of Nbla00365 16 Zinc-Finger Domain Protein Nbla00365 MRD63 MRD64
Location (GRCh38)
6:87151803-87265943
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015021.3
Sequence length
12341.0 nt
GC content
0.3673

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2988.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3241.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3428.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001351444.2 NCBI
GCGUACGCGACGGAGCGGGGUGUGAAGAUGGCGGACGAAGAGGCCGAGC… 12486 nt 0.3668
NM_015021.3 NCBI
GCGUACGCGACGGAGCGGGGUGUGAAGAUGGCGGACGAAGAGGCCGAGC… 12341 nt 0.3673
Summary

This gene encodes a growth hormone-dependent, zinc finger transcription factor that functions as a tumor suppressor. Naturally occurring mutations in this gene are associated with gastric cancer, colorectal cancer, and chronic lymphocytic leukemia. [provided by RefSeq, May 2017] CIViC Summary for ZNF292 Gene

Forensic Context

A study in human traumatic brain injury (TBI) patients identified the ZNF292 as one of the top five downregulated long noncoding RNAs in brain contusion tissues, with a log2(fold change) of -6.49194, and this differential expression was validated by quantitative real-time PCR [Zhang et al. DOI:10.097/WNR.0000000000001756]. This differential expression signature was validated by quantitative real-time PCR, confirming its significant downregulation and potential role in the pathological processes following TBI.