Basic Information

Symbol
ZNF500
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 500 ZKSCAN18 KIAA0557 ZSCAN50 Zinc Finger Protein With KRAB And SCAN Domains 18
Location (GRCh38)
16:4748239-4767624
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021646.4
Sequence length
5824.0 nt
GC content
0.5871

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2762.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2848.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1450.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001303450.2 NCBI
ACGGCCUGGUUUGCACCCCUGGUUUAGGGUCUUCGGCCCCGGCUCUGGC… 2385 nt 0.6172
NM_021646.4 NCBI
ACGGCCUGGUUUGCACCCCUGGUUUAGGGUCUUCGGCCCCGGCUCUGGC… 5824 nt 0.5871
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.