Basic Information

Symbol
ZNF510
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 510 KIAA0972
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_014930.3
Sequence length
6507.0 nt
GC content
0.4046

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1779.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1902.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2087.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((..((((...((..((((((.(((((...((((((((((((.((.....((.((((..((........))..)))).))...)).))))((((((......)))))).((((((((((((((((((.....((((.(((((..(((.....((.((((((....)))))))).....).))..))))).)))).((((((...((.(.(((((....))))).).)).(((((......((...(((((.....)))))..))......))))).((((((((.(((..((((....((.....))....)))).((((....((((((((((........((((((((.(((.....((((((((..((..((((.........)))))).....)))))))).......)))..(((.((((....)))).))))))))))).(((((........)))))((((((......)))))).)))))))))).....))))....))).)))))))).)))))).).))))))))))).....))))))))))))))..)))))(((((((((((((((.((..((((....))))((((((.(((..((((.......(((.......)))((((((.((....(((((((((........))))).))))..((.(((((.((((((.((....))(((((((.(.((((.((.(((..((((....(((....)))...))))..))).)))))).).)))))))((((((....(((((((((((((((((...........((((((......))..))))..((((....))))((((((((((.................((((((....))))))...(((((...(((((((.............))))))).))))).((((((.(.((((.(((.....((.(((((((((...)))))))))))))).)))).).))))))...........((((((.......))))))...(((((...)))))..)))))))))).((((......)))).....)))))))))))))))))...))))))....)))))).)))))..)).(((.....)))...((((.........))))...((((.((((((.((....((.((((.((...((.((((.(((((.........(((((...)))))............((((((..(((....)))..))))))...(((..(((....)))..))).)))))..)))).)))).)))).))...))))))))))))..((((((((.((((((((..((((.....((((((...(((((.............((((((((.(((((......((.(((......))).)).(((..((((((............(((.(((.(((((......((((((..((((((....(((((((((((((((((...(((........)))......)))).))))..)))))).)))....))))))..)))))))))))..))).)))))))))))).(((((((((..................))).)))))).((((.((....)).))))((.(((..(((...)))))).)).....(((((...(((........))).)))))((((((((((((((((....((((((.....(((((((((..(((.((......)).)))....))))(((...((((((..(((...((..((.((.......(((((((((((((....((.((...(((((..((((....(((((((..((....))..)))))))..((((((.((...(((.(((....)))..)))..)).))))))...........(((......)))......(((((.........))))).((((......(((((((((((.....((((((.(((.((......)).))).)))))).....((((...............)))).........)))))))...))))))))..((((((......))..))))...(((......))))))).))))).....)).))....))))))))))))).......)).))))...))).)))))))))....((((((((..((((((.(((................)))..))))))..))).)))))...........((((((.(((((((.(((((....((((((((((..(((((......(((((((...))))))).(((((((.(((......................))).)).)))))((((((....((..(((((...((.........)).)))))...)).....))))))...(((((((...((((.((.((.((((((..((((..((((((.....)))))).)))).(.((((((......((((((((((((((((....((.(((..((((.((((((..(((......)))...))))))..)))))))...((((((......((((((.........)))))).................((((.((((.((.((((............(((........))))))).)).)))).)))).......))))))((((((((((((((.....)))))..(((((..........))))).((((...........))))...(((....)))..))))))))).....((((.....))))((((((((((.......))))))))))..))...))))))))))..))))))..)))))).).)))...))))).)).))))..))))))).))))).))))..(((((((.........)))))))))))))))))).))).)))).))))))((((((.(((....((((.....)))).....)))....)))))).......))))).....))))))...)))))))))))...)))))..))))))))).)))).((.((((....)))).))((((((((((((((((.((..(((((((((......((..(((.....((((((.((((((((.....((((.....((((......))))...................((((((.....))))))((((((....))))))...((((((......((((((((.....((((((((.(((((.......))))).))))))))...)))))))).((.(((((((....))))))).)))))))).(((......)))...))))))))))))))).)))........)))..)).....)))))))))..))))))(((((((........)))))))....)))))))..(((((((......)))))))....((.(((((....(((((((...(((((((((((....(((..((((((......((((...(((((((.....)))))))))))..))))))))).))))))))).))....((((.......))))....)))))))..)))))))))))).........)))))))))))...((((((((.(..(((((.(((((........))))).((((((..(((...)))((((..((....(((....((((....))))....)))..)))))).((((((((((.((.(((....))).)))))))))))).))))))(((((((...(((....((((((........((.(.((((((((((((..((((((......))))))...((((..(((...)))((((.......)))).....((((..((((((((.((((............((((((((.......((((...))))........((((.(((((((....)))))))...))))............(((((((..((((((((((((...............((((((((((((((...(((((((.........(((((((.(((((....)))....)).)))))))((((.....))))...((((((((.(.((((....)))))))))))))..(((.((((((((((((((.....)))))....((((......))))...((((((((((..............))))))))))........))))))))).)))(((((((.(((((...(((((......)))))..(((((..(((((((((.(((.(((((...((((((((.((((....)))).))))))))..)))))...........))).))))))..)))..)))))..(((((.((..(((.......))).)).)))))((((((.(((...(((((((......)))))))...)))..))))))..))))).))))))).....)).)))))...))))))))))))))........(((((...(((((.((...)).))))))))))(((((......))))).((((..(((((....)))))..))))((((((..............))))))(((((((........))).)))).(((((.((((((((((((.((((......)))))))))))...)))))))))))))))))....((((((((((((((....))).))).))).....))))).)))))..)))))))..)))))))))))).))))))))..)))).(((((..((((....)))).)))))))))....(((((.......(((((((((...((.(((((((((...((((((((..((((((((......((((((((((..(((((....(((((.(((.((.(((.((..(((((((.(((((.((...........((((((.(..(((((.....)))))..))))))))).)))))....(((((....))))).......(((..((((...((((((....))))))..))))..)))...((((...((((((((((((........))))..)))..)))))....))))((((((.((.....)).))))))....(((((((((((((.....))))))))))))))))))))..)).))))).))))))))....))))).....((((.(((.((((.(((..(((......(((.(((....))).)))......))).))).))))))).))))........((((((((.((((((((........(((((((.(((((..(((.....((((.......)))).....)))...))))).)))))))..(((.(((((((((.((...(((((.((.((((((..............)))))))).))))).....)).))))))))).)))....))))).)))..))))))))......(((((.....)))))..))))))))))))))))((((((...)))))).....))..)))).)))).............)).))))))).))...)))))..)))).....))))).)))))))))))).).))........((((((.((((((((((((..((((....((((......))))..((((....(((((....)))))(((.((((((..................))))))))).((((((((((.....))))...))))))..(((((((........))))))).....)))).(((((...........)))))......))).)..)))))))))))))))))).(((((((..((((....))))....)))))))...))))))....)))....)))).)))...((((....((((..((.((((((((.((((.....))))..))))).)))))..))))...)))))))))..)))))))))..........((....)).))))..)))))))).))).))))))).)))))).....)))).))).))))))...(((((..(((..(((((((.......(((......))).......)))))).)..)))..)))))((((((((((((((.........))))..............))))))))))...((((((.(((((((..(((((........((((.......))))((((((.((...))))))))...)))))..))))))).))))))..((((.(((((....)))))..))))(((((((.........)))))))...)).)))))))))))))))((((..(((((((..........((((((.((((.......))).).))))))..........)))))))..))))........((..(((((.(((.....)))...)))))..))..))))))..))............))))..)).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,,,{((,{,(({((((({..({(((((,,..))))}(({{{{,(,,{{.....})|.|{||}}||},..,,,}))}}}},,.}},..((((((.{(((((......}))))}(((((((((((((((((({.....((((.(((((..(({.,...((.((((((....)))))))).....}.))..))))).)))).((((((((((({{.((((,....|||||.|,|}||||{,||,.,..,.,,{(((...(((,((((((((((...(((,({((,,.{(({,{{{||({{{....({.....}}.,..))}}.,|||..,.}}}}|,||{|.....,......,}}},},,.}))))))))}.}}}.,..)))|.....,,..||||{|.{{.||||}|{({(({..,,{({{((((.((((....)))).))){(((((.|.(((((........))))).||.}))))}...)))))..))))))}}}...}}.}.)))),}})},...,))).)))))).}.))))))))))).....)))))))...||||......,{((((((((((((((.{{..((((....)))){{{{,,.{{{..{{{{.........,......,|||((((((.{(,...(((((((((........))))).)))},,(({(((({.{((((({(,....)){((((((,(.((((.((.(((..((((....(({....}))...))))..))).)))))).).))))))){{((((..,.(((((((((((((((((.....,,,...{({{{(......,,..,}}},,|{{{....}}}}{(((((({,,....{{{({{,......||||||....}}}}}}...{{(((,..(((((((.............))))))).})))).,,,,,,.|,{{,,.{{{,....((.(((((((((...))))))))))),,,.||||.|{|,,,,....})).))),((((((.......))))))..,((({{....,,,,,}}))))))))}.{(((......)))),|,..))))))))))))))))}...}}}}|,..,,|}}}}}.))))}..|}||{{,,,,.}}},,.{(((|........||||{,,{,,..{{,|||||||...{{{({{{,,,,{.|{.((((.(((((.........{{{{,...|||||.,.........|{(({({..(((....)))..}}}})}},.(((..(((....)))..))).})})}..}})},||||,|.}},},..,||}}}}))),,}..|||||||{.{{(((({{.,((({...{|((((({,{{{{,.........,...,,,,,{,.||..||{|||{,,.((.(((......))).)).,{{..||{|||...,........{{,.,{(,{({(({...,,((({((,,((((((,,..(((({{{{{{((((({{,..(((......,.)})...,{,|||||.|||,.||||}}.|||....}|||||,,|}}}}}|,,},,.}},.},|||,}},))).(((((((((..,...............))),}))))}{((({....,.,}|,}}|}{{.(({..(((...}))))}.||...,.(((((,,.(((........))).}}}}|{{.{||{|{{|(((...{{((({...,}))})),,,)||,},{{,.{{.,,,,.}},})),...||))||}},,))),}}}}.}}}}.}}}|,||}}.....,.{((((((((((((....((.((...({(({,.{{{.....(((((((.,((....)),.)))))))..,{{,((,((....{{.{(({{{,|||,.|||..||,|||||,,,.,..{,,..{((.,..,,|,},}....{{{{{.........))))).|{{{...,,,({{{(((((((.....((((((.(((.((......}}.))).)))))).....((((,,,.......},,,,)})).........)))))))...)}}}}})}..||||||..,.,,},.,)))),.{(((......))))}}}.))))}.....)).)),...))))))))))))).......{{{..{{.,,,,||,.}||,,{{,.,,((((((((..(((((({{{{.,..,.......,,..}}}.|))))))..))).)))}}.|||,...,,.((,,,,,|{{|{{,.{{{,..,}}||,|||||||..,,,,,.,....|||||||,,,)})))))...}}}}}}|||,||}}}}}),,...............{((((((.,,{,.(({......}}}.}}.,,.......})))))).(((((((......)))))))..(((((({.,{((((.((.((.((((((..((((..((((((.....)))))).)))).{.(((((({,....,(((((((((((((((,,,,{{.(((({..(({(({{((.{((,.{{{.,|},...}||||,..}}}},,,....,|.}}....,}((((((.,.....}.)))))).,....,,}}}..}}}}}(((((,,...({(((({,...{{{{{{{...........}))}})).|,{{{{|{|,{({,.....(({({{(((((,({,,{||,,,,}})))))..(((((..........))))).{{{{...........)))),}..)))}}}}...,||||},,})}},)}}.))))..)))))((((((((((.......)))))))))).,)}...})))))))))..))))))},}))))).}.})}...)))}}.)).)))),,))))))),|||||.}|||,{(((((((.......,,||||||{{{||{{{{{|,.||{{.|||,|,,,,,.,{||}}|.,,,||{{{..,,{{{||{,.,{{(|,,,{,{..||||,{,,.,|||,..,...,.,......|||||||||,,...|,|||....,,,..,|{{{((.(((((((....)))).)))..}|||||,,,{((({(({{((((((((({.....,(,{((,.{{{,((({{(((({{{{{{,.,.,(({{,,,,,((({....,,||||....,,||,..,,}},.,.||||||}},,}))}})){|||||.,,,))))))}},|||||,..{((,((((((((...,.((((((((.(((((.......))))).))))))))...))))))))))}.(((((((....))))))),|||||,}|.(((......)))...}))})))))}}))))}))),.......}}},.,,...,}))),)))),..})))))|||{{{{........,))))}|.,,,}}}))),}.|||,|||}}.}}}),,)))))))))))}},,}},}}}}}}}}}}}}}}}||}|||,|,|,|||}|,,,}}}},,,,,,|||,..,{{{{|||,}},.|((.((((((.((.(((..(((((((((({(((({..{((({({{.,...(((....})).})}},{((({,|..((((..,({((((.((((((((((..,((((((.......}}},.(((((........))))).((((((.((({...}}}|,((((,({{...((..{{(,(({.{{(({(({{{(({(.((((((.((((((((((.{(.(({....))).}})))))))))).)),.}))).,,,,,...(((((,.{((((({{...,,{{{({.....,,}||,{..((((.({({{((((({,,...)))}},{((...,,.,|||}.......)))}}},|||}...,,)}))|||{{{|,|({{{{,.,{{,.,,|,,,})},),,|(((...||}}..........}}}||||||}}}}}),)))))}}}}.,,))})))))}}.))),)}})),.}}}.}})).),.............,}},,,}))))}.))))))|{(((((..((((({,(((((((,(({{,..,,|||....}},)))))}}((((.....))))...,{{{{{{(.{,((((,,,,,}}}}}|||}}},.}|,.......}}}}|||||..,,.))}}},,,}|}}|}},...,}}}})))).))))))}}},))))))))))))))))))))..},)))))))))))))){(((((((((((((((({..,{(((((..{((((((,,,{(((((((...,,,,.,,)}}||||.,.((((((((.((((....)))).))))))))...(((((((((...((((((({{{.{,,.,,,..((({((((({,(.((..(((.......))).}}}}})))))}})),{,({{{,.(((((((...,{({((((((.(((((....{{,.............})}..)))))...)))))}})).},.)))))))......(((((...(((({.{{...)).)))))))))){((((......))))}.}})}},..},))}))))))).,.))))))))).......,,....))))))})))))}...((((....})))(((((....})))).}))))))))}})},)))))....,)))))))))))))).)).))))))))).,,|||,,,,,,,|||,,})))}))),}))),..,{{{{.{{{{{{..{{,{,,,..,{(({.,.,||}}}|||||,,,,{((..(((((..((({....}))).)))))..))}...,{{{,.......,{{{{{|{{.,.|,,|||||||{{..||||{|||{..,{((((((......((((((((((..(((((....(((({,(((.((.({(,((,.((((((({{{(({{(({{..((({({,((((((.(..(((((.....)))))..))))))).,.,,,.,....(((({....})))).......(((..((((...((((((....))))))..))))..))).,}}|||}..}|}|}.}},,...{|,|,,,,.,.,|}},}}}},......{{({(((,({.,,..}}}))})}}}}},...{((((((((((((.....))))))))))))))))))))..)),))})).))))))))....))))).,{,.((((.(((.((((.(((..(((....,,{((.(((....))).})).,,...))).))).))))))).))))....,,..((((((((.((((((((........(((((((.(((((..(((...,.((((.......)))).},..)))...))))).)))))))..(((.(((((((((.,{...(((((.((.{(((((..............)))))})).))))).....,,.))))))))).)))..,,))))),,))..))))))))......(((((,...,)))))..))))))))))))))))((((((...)))))),....,,.,)))).)))}.....,,|...,,||.||}}|}}.,|,,|}}}}}.,||},....,}||||||,{|{{,|||(((((((...{{{{{((((,,.,,,|||{{||||}}.}||}}||((((......)))),}||||....(((((....))))),{{.(({{{{{(({.,,.....,,.))}))))))}}}.(((((({{{,.....,}}}...)))))}..(((((((........))))))}...,,}|,,.{{|||..,|,......,)))}.....)))),,..))))))))))))}}},,..(((((((..((((....))))....))))))).,..{{|||||||||||{,,{{({.,{||,.{,|||...{{(({,{,.,|||||||}||||}..,})))|{{|}||||{..,}}}))))})),}}},||,..,}},})),.......,....,|...})),))))..)))))))).))).))))))).))))}},,,}})}||||}|,}}},}},,,{((((..(((..(((((((.......{,({{{{{.,,,.}},}}})))))),),.)))..))))),{((((((((((((.........))))..............)))))))}||{.|{((({|..,,|}}}))}||}},.,,....((((.......))))((((((.{{...}}))))))....)))},|}}}}}}},}}||||.,{(((.(((((....)))))..}))){||||{|,,,,.,,,,)})))))},,)).))))))))))))))},{{{..(((((((,{,,.,{,..{({(((,.(((.......))).},))})}}.,,.,,}...))))))}..}}}},,,..||||,|,{,{||,|||},}},))),,,|||||...........,,.,,||||{,....})))))....))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACUUUCCGGCUUCUCCCUGUUAGUGUUUGCUGGUGCAGAGGGUUCGCAG… 6959 nt 0.4189
ACUUUCCGGCUUCUCCCUGUUAGUGUUUGCUGGUGCAGAGGGUUCGCAG… 6448 nt 0.4045
ACUUUCCGGCUUCUCCCUGUUAGUGUUUGCUGGUGCAGAGGGUUCGCAG… 6507 nt 0.4046
Summary

This gene encodes a krueppel C2H2-type zinc-finger protein family member. The encoded protein is expressed in several cancer cell types and may be a biomarker for early diagnosis of these cancers. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.