Basic Information

Symbol
ZNF518A
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 518A KIAA0335 ZNF518 Zinc Finger Protein 518
Location (GRCh38)
10:96129695-96205288
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001330736.2
Sequence length
8345.0 nt
GC content
0.3614

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2033.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2201.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2292.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278524.2 NCBI
GGAGACCAUUCCCAGUCAGCAAGGGCUUGGGAAGUGCAUACAGUUCCUG… 8340 nt 0.3583
NM_001278525.2 NCBI
AAUACCCGGAUGGAAGUGUAAUGGCCGCCAUCAGGGACUCGCAGGCAAU… 8001 nt 0.3490
NM_001278526.2 NCBI
GGAGACCAUUCCCAGUCAGCAAGGGCUUGGGAAGUGCAUACAGUUCCUG… 6625 nt 0.3594
NM_001330732.2 NCBI
AAUACCCGGAUGGAAGUGUAAUGGCCGCCAUCAGGGACUCGCAGGCAAU… 7974 nt 0.3488
NM_001330733.1 NCBI
AUUCAGCGCUUCCGCUUAACUUGCCGCAAAGUUUUUCUGGAGAAGUCGG… 8542 nt 0.3643
NM_001330734.1 NCBI
CGAGCUAUAGGUUCGCAGGCCCGACUCGACGGCGUCCCUAUUGCUGGCC… 8243 nt 0.3555
NM_001330735.1 NCBI
AUUCAGCGCUUCCGCUUAACUUGCCGCAAAGUUUUUCUGGAGAAGUCGG… 8391 nt 0.3619
NM_001330736.2 NCBI
AACUUGCCGCAAAGUUUUUCUGGAGAAGUCGGGGUUUUUUUGCCGAGCG… 8345 nt 0.3614
NM_001330737.1 NCBI
AUUCAGCGCUUCCGCUUAACUUGCCGCAAAGUUUUUCUGGAGAAGUCGG… 8418 nt 0.3624
NM_001330738.1 NCBI
AUUCAGCGCUUCCGCUUAACUUGCCGCAAAGUUUUUCUGGAGAAGUCGG… 8511 nt 0.3636
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the krueppel C2H2-type zinc finger protein family. The encoded protein contains five zinc fingers and is likely a nuclear transcriptional regulator. Numerous transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

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