Basic Information

Symbol
ZNF518A
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 518A KIAA0335 ZNF518 Zinc Finger Protein 518
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001330736.2
Sequence length
8345.0 nt
GC content
0.3614

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2033.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2201.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2292.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......))))).(((((((((((....(((......)))((((((....(((......((((((..(((((..............))))).))))))......)))..................(((((.....)))))(((((((.((((((((.((((.((((((.(((((.....)))))))).......((((.......))))(((.(((((((((((.(.(((((((..((((..(((.((((.(.((((((.((........)))))))).))))))))....)))).....))))))).).)))))....((((((((...)))))).)))))))).)))))).)))))))))).)).))))))).....((((..(((((((((((((...)))))))....))))))))))))))))...)))))))))))((((...(((((.(((...(((((((.((((.(.((((((.((((.(.(((.((((((((.((((.((.((((.(((..((((((......((((((((.((((((((.........)))))))).)))....................)))))...........)))))).))).)))).)).)))).))))))........))))).))))).))).))).).)))).))))))).))).))))).))))((((((((.(((.((((........)))))))((((.(((((((((.((..((((.......))))))((((((((((.(((((..((((((((((((((((....((((.((..((.....))..)).)))).....)))))).........))).))))))))))))((((((((((..........(((((((((((((((.((((((...((((...((((((.......))))))))))............((((....))))..(((((((.......((((((..(((.(((((....)))))...)))..)))))).........)))))))(((........))).....))))))))))))................)))))))))...((((((((((((((........((((....))))..........((((((((((......(((.(((((....(((((..((((.(((((.(....).))))).))))....)))))......))))))))......)))).....))))))........)))))))))..))))).......((((......)))).((((((....(((.(((((((.....(((((....(((((((((((((((((((((..........((((((((((((.........)))..((.((((..(((...................)))....)))))).(((((((((.((((((((((..........)))))).)))).)))))))))(((....))))))))))))..((((...)))).....)))))))).((((((((.(((((.(((((((((.....(((((((((.((....)))))..))))))......(((((((...))))))).....(((((((...(((.....))).)))))))..))))))))).(((((.(((..............))).))))).....))))).)).))))))..)))))))))))))...)))))......))))))).))))))))).((((((.((.......(((((((..........................))))))).......)))))))).(((((...(.(((((.....(((((....)).)))....))))).).....)))))...))))))))))((((((((.(((.(((((((.((((((((....(((((((((.((((.((((((((.......((((((....(((.......((((.....))))....))))))))).)))))))).)))).....((((((....((((((....(((((((.(((..(((((((((....((((((((((((((((((((....((((....(.(((((((((((((((.((((((.((.....((((((((..(((((((((...((((((((.(((((((((((((((((((..((((((((........(((((((((((.................))))).))))))((((.((((..(((((.(((........))...).)))))...)))).))))................(((((.((((((((((((..((.((((((((....(((...)))..)))))))).)).(((((((........(((((((((((..((((((.((((((.(((....))).)))))............).))))))....((((.(((...((((..((((.(.......).))))..))))...)))))))...(((((((((.((((((..((((((((....((........))....)))))))).))))))(((((((..(((....(((..(.(((.....(((........))).....))))..)))..)))..)))))))(((((((((.......)).))))))).......)))))))))(((...))).)))))))))))..))))))).((((((((((..........))).)).))))).......((((((((((......))))))).)))))))))))...)))).)))))(((.......))))))))))).))))))...(((((....)))))...............)).))))))))).))..)))))))).)))).)))))(((...)))....................(((((...))))).))))))))...(((((((((((.....(((((...((((((...................))).)))....))))).....)))))))))))..(((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((......))))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...........((((.((((((.((((((....((((((.((((((........((((.(((((..............))))))))).(((((((((((((.(((((......(((((((..(((((((..((((((((((.....))))))))))..)))..)))).......))))))).......).))))..................((((.(.(((......))).).)))).............))))))))))))).....(((..((((((((((..........((((((((.(((((.(((((((((..(((..(((((((((....)))))))))......((((...(((.(((((...........))))).)))))))...((((...)))).(((((((((.(......))).))))))).(((((((((((((((.(((((...........(((............)))(((((((..........)))))))......((((((.....((((......(((..(((((((..((((.((.((.((((((.............)))))).)).)).)))))))))))..))).....)))).........((((..(((.(((((((((..(((((((......)))))..)).))))).....)))).))).))))....))))))......((((((......))))))....))))))))))((((((........))))))..))))))))))..(((...))).))).))))))))).))...))).)))))))).........))))))))))..)))((((((((...((((......(((((......)))))....)))))))))))).((((((((((((((((((.......((((.(((((.........(((((((((((........(((((((((.(((((((.........)))).))).))......)))))))(((.(((((........))))).)))((((((((.....(((................)))...........(((((....)))))....)))))))))))))))))))))))).)))).....))))))))))).....................((.(((((.....((((((((..((((((.((((((((((((.....((((((.((....)).)))))).....)))))....(((((((((((((.(((...))).))).))))..(((((.(((((.....................((((....)))).....)))))..)))))((((((((..(((((((((.(((((((((((..((((....(((((.......((((......))))...(((...(((((..(((((((((((....)))).))......)))))..)))))...)))..)))))...))))..)))).))))........((((((((((...(((((((((..((((((..(((((((......(((((........)))))....))))))).(((((((((..((((((((((..((((..((((((((.(((..((....))..((((((.(..(((((((.......(((((((((....((((((((((...((((((((...(((.....)))..(.((((((((........(((((((((((..((((((((((((.(((........((((((....((......))....))))))......))).))))).).))))))..........((.(((((.(((((...((((........))))...))))).)).))).)).............))))))))))))))))))).).((((((..(((((((((((............((((((((((((((((((...((((.......(((........(((.((((..(((((..(((((((((.(((..............))).)))).............((((......................))))...((((((....))))))........)))))))))))))).)))))).......))))..))))))))..))))))))))))))))))..)))..))))))..((((((.((.((((((.(((((((((((((.((((..((((.(((((......((((((..........((..(((((((((((......((((((((((((((...((...(((......)))....))......)))))))(((((((((.((((((((....((((((((((((((..(((((((((((((((...((((...((..(((.((((...........)))))))..))..))))...((((((....))))))........)))))))))))...))))....)))))))).))))))))))).....((((((((((..((..(((......)))..))....))))))))))..((((((((((((.((((((.(((((.........)))))))))))))((((((.((((.....(((((....)))))......))))((((((((((((((((((.........)))))))).))))).)))))).)))))(((((.(.......).)))))))).)))))))((((((.......)))))).((((((.(((((........))))).))))))....(((((......))))).......))).)))).)))))((((((((((((((............(((.......)))..))))))))))))))((((......)))).))))))))))))))))))..)))))))).....))))).))))...)))).)))))).((((((((........))))).)))))))))).)))((((((((......(((.....)))....))))))))...))))).)))))).))))))))....))))))........(((((((.....)))))))))))....))))))))))))))))..).))))))......(((((((((((.(((((((((((....))))).))))))(((.(((((....(((((((....)))))))))))).)))(((((......)))))..))).))))))))............(((((......)))))..)))))))))))...(((((((...(((((.((.((((....................)))).)).)))))...))))))).......))))..))))))))))((((....((((((((.....))))))))...))))....)))))))))...(((((....))))).((((........)))).........))))))...))).))))))...)).)))))))).))))))))))))..)))..)))))((((.((((((..(((((...)))).)..)))))))))).)))))).(((((...)))))(((((((....))))))).)))))))..)))))).)))))))).......)))))))(((((......)))))..)))))))(((((((((.((((....))))))).))))))....)))))).)))))))))))))))))).))))....))).))).))))))))....((((((...((((((...................)))))))))))).....)))))))))))))))))))....)).))))))((((((((((.(((.(((((((((...(((.....(((((.....((((((.((....)).)))))).......((.(((....))).))..((((...(((.((((((((....((((((((((((((..(((((((...((((((((((((((.(((((((...(((((((((((((((((......((((((......))))))....)))))))))).........(((((((((..((((((..(((....)))..)))))))))))))))))))))).....))))))).)))))).....))).)))))))))))).((((..((((((.(((((((...(((...........)))...)))))))((((.(((.....))).))))......(((...((((......))))...)))..))))))..)))).))))))).)))))))...((.(((......)))))....)))))))).))))))).....((((((..(((.((((....))))...)))...))))))((((.....))))...))))).....)))..))))))))).(((((((.......)))))))))).)))))).))))....................))))))))((((.((((.........)))).)))).....((((((.(((((((.((((((........)))))))))))...)).)))))).....((((((..((((.((.((....)))).))))..))))))(((((........))))).((((((((..........))))))))...))))))).)....))))....))))))...)))))))))))))).........(..((((((((..(((....))).))))))))..)......(((((.(((((((((.....(((......))).......)))))))))..))))).......)).)))))))......))).)))))))))))))....))))))....((((((((((.(.......).)))).))))))(((((((.....))))))).......))))))))).))))).))).)))))))...))).))))))))((((((((((((((((..(((((........)))))..)))....)).)))))))))))((((((.......))))))..))))))))))...(((((((((...)))))))))))))))))).))))............(((.((((.......((((...)))).........)))).)))..........((((((...)).))))......(((..(((...)))..))).....)))))))).((((((...))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{,,{{{{{,,}}},.,((((((((((.,{{(((......}))((((((....(((,...{.((((((..(((((.........,....))))).))))))|,,,||}|}.......,,,,,.,,.,,(((((.....))))){{{((({,{||{((((.((((,({((((.(((((.....)))))))),.|||..{|||},.}}..))})|||.(((((((((((,(,({(((((..((((..{{{,|,{|}|}|{||||.|{,.{,{{{.||||,,}|{||||,|||{.,.},||....,))))))),,,))))),,,}{|||{(({...}})))).}))))))).,,,})).)))))))))).)).))))))).....((((..(((((((((((((...)))))))....)))))))))))))))),,.))))))))))|{(((,,.(((((.(((...(((((((.((((.,.((((((.((((.(.(({(({((((((.((((.((.((((.(((..((((((......(((((,{(.((((((((.{.....}.)))))))).)||{{{....}}}},........))))).....,.....)))))).))).)))).)).)))).))))))........))))).))))).)))))}).,.)))).))))))).))).))))).}}},|||||{{{.((({((((,,,...,,}|||||}{(((.(((((((((.{{..((((.......)))},,((((((((((,(((((,,(((((((({{((((,,..|,||({,{{,,(,,,,..|||,||.}}}},,,..}}}}||{,.......)))),}|||||||}}}(((((((({,..........(((((((((((((({,((((((...{(((,..{{{{{{..,,...,|||||,,}}....,,,,,...{{{{....,}))..{((((((.,.....((((((..(((.(((((....)))))...)))..)))))).........))))))}(((........))).....))))))))))))},.......,,,....|}))))))}||,||||.||||||||.........(({,....})))...|||....(({{{{{||,......(((.(((((,{..((((({{((((.{((((.{....}.))))}.)))}.}|,})))).,{{.{|||||||,.{{{..||||.....,,,))),....,.))).,}))))}}),))}.......((((......)))).,|{{{{....{{{.{(((((({,...(((((....(((((((((((((((((((((..,,,,....(((((((((({{......,,,},,..{|,{{{{,,{({...................,,,....},,},..{((((((((.((((((((((.......,,.)))))).)))).))))))))),||,...,,))))))))))..{{({...}))).....)))))))).((((((((.(((((.(((((((((.....((((((((({(,...,)}}))}}),,}}}......(((((((...)))))))..,}.{((((((,{,{{....,.))}.))))))}..))))))))}.{((((.(((..............))).))))}.....))))).)),,)))))..)))))))))))))...)))))......||||||,.,,,,))))).((((((.{(.......{((((((..........................))))))).......)))))))).,}))))))}},||||.}}},|||||,,..)),}....,,)))}},).}}}.}}},,...})))))))))((((((((.{({.(((((((.((((((({....(((((((((.((((.((((((((.......((((((....{{{.......((((.....))))....))))))))).)))))))).)))).....,{((((,...(({({(.,,.(((({{,..,...,{{(((({(...,((({(,(((((.((....}},})))|,|,.,,))}},}}|.,,{,((((((,,{{(,(,.....|.|||||},.(((((((({.,.((((((((.((((((((((({{((((((..((((((((........{(((((((((({({......}}}.....})))).)))))|((((.((((..(((((.(((........}}}..}.))))}...)))).)))),,.,.{{,...,}}..{((((.((((((((((((..((.((((((((....(,....})}..)))))))).)).{{{(((({{{..{,,((({{{{{{{,..(({(((.,{((((.(((....})).)))))....,,,,,,..|.}}}}}}.,{{(((({{((,{.{(((..((((,{...,...}.|}}},.}}},...,,.||,.((((((....))))))..},..,,{{{||,.....}}}}},,})}}}},,,|,}}},,},}}}}{{{|{{{..{{{,,..,(({{{,.,,{,...|||....}},,)},....|}}}..,},,.,))}..))}||||,{((((((,.......}}.)))))))}},,,,.,,||{{{...))))).)},)))}}})))))..,,}}))).{{{{{(((((,,......,,|||.}},,}}||,......|{|||{{{{{.,,,,,)}}}}})))))))))))))...)))).))))){{{{{.....,)))))))))).)))))).,,(((,(,,..,}))).}},,,.........}}.))))))))).}),.)))))))).))))))}}))}}},.,}|}..}}}}}}}}}.{{,,,,,.(((({...})))}.,|||||||,..{{{{{{{{|||,},},{{{{{.{{((((((,.......,,,.,..,.,,})).))).,}.}}}}}.....})}))}))}}}|,((((((({((((((((((({{{{((((,({((((.{(((((......|}}}}}...{{(((.((,,((.....})}.}}.}}}||,,.........{(((.((((((,{(((((....((((({.((((({...,,,..((((.(((((..............))))))))).(((((((((((((.(((({,.....(((((((..(((({{{..((((((((((.....)))))))))).,)}}..)))}.......))))))).......}.)))).{,...............((((.(.(((......))).).)))).............))))))))))))).....(((..((((((((((..........((((((((.(((({.(((((((((..(((..(((((((((....)))))))))......{(((...(((.(((((...........))))).))))))}...((({...}))).((((((({{.(......,)).))))))).(((((((((((((((.(((((,,...,|,.,.(((............)))(((((((..........)))))))..............,,{((((..,...{{{..(((((((..((((.((.((.((((((.............)))))).)).)).)))))))))))..}}}.....))}}.........((((..(((.(((((((((..({(((((......)))))..)).))))).....)))).))).))))...,{{{||,...,}}|||{{|,,,...)))))}....}}}}}}))))((((((........))))))..))))))))))..(((...))).))).))))))))).)}..,))).)))))))).........))))))))))..))){{{{{{{{,{(((((......(((((......)))))....)))))))))}||.((,{,..{{(((((((((.......||||,|,,||...||{.,.(((((((((({,.......((((((({,.,||((({|...,..,.}}},.)}||||.||||,)))))))(((.(((((........))))).))),(((((((.,{,.({(.....,..........,}}.,.........(((((....)))))....))))))))})))))))))}||.|}|}.,,,....))))))))))}..}}................,{{.(((((.....((((((((..((((((.(((((((,,,((,{,..,{((({,{{,.,{||.||}}}}|.,..})))}....{((((((((((((.(({...,)}.))),}))}..(((((.(((((.,{{,.......,,...,...((((....))))..,..)))))..)))))(((({(((..(((((((((.,{{.,,,,{,({{,,,,}}}.|,{{{...((((((((,.....,|,{{{..{,.||{((((,.(((((((((((....)))).))......))))),.))))),.,}}}},,)}||{{,|}}}.{||||{|,||,,,.....{{{{{(((((,..,,,{|||||,.,,,,,...(((((((......{((({........}))},....))))))).(((((((((..((((((((((..((((..((((((((.(((..{{....}|,,((((((.(..(((((((.......(((((((((....((((((((((...((((((((...{((.....}}|.,(,{(((((((.......{(((((((((((,.((((((((((((.(((........((((((..,.((......))....))))))......))).))))).).))))))..........{{,||(((,(((({...((({,{{..,|,}}}),..)))}}.||,|}|,}}........}},,}))))))))))))))))))).,.||{{|{,,{{{{{{{{{{,...........,{{(({{{(((({{{{{{{{,,((({.......,,{...,,,..,,,.||||,||{{,,..,{{(((((({({({........,}}|.,{{{{,,,..}}},.,.|}}}|}}|.....,.....,,.....|},,||,....((((((....)))))).....,,.|||}}}||,,..}}}}},})).....,,}}}}..}))))}}|,,||||||}|||||||||}}..}}}..))}|}},,(((({({{{,(({{{{{{.,,|||{{{{||.|||{.,|||{,{{{{|,,,.|,|||,||,,,|}}|..,||,.{(((((((({,....,{((((((({,{,{{{........(((......)))....||......}}}}}},(({{{{{{{.{{{(((((....(((((((((((((((((({{(((((((((((...{{,,...((((.....{{.{{{.{((((...(((.......))).))))}.|||,|,...,,))))..,,....)))))))))))...}),))))))))))))).))))))))))).....((((((((((((((({,(,.....,.)))))),...})))))))))..((((((((({{{.((((((.(((((..,......)))))))))))}}{({({{,((((.....((({(....)))))......}})){{((((((((((((((((.........)))))))))}}))).)))}}},))))){{|||.|,|.,...)}))))})))}})))))){{{{{{,,,,...}}}))}.((((((.(((((........))))).))))))....(((((......)))))...,,,.,||,|}}}.||}||((((((((({(((,.......}}}.}}},..)))},}}.},)}))))}})))}}|((((......)))))))))))))))))))))))..))))}))),,},.))))).))))...)))),)})))),{((({{{{........))))},)))},}}}}{{(({({{,,,..}}}}}}||,,....,}}....,.,|||||,.,}}}}},)))))).))))))))....))))))........(((((((.....)))))))))))....))))))))))))))))..).)))))).,....(((((((({{(.{((((((((((....)))))}})))}|{((,,,,,(,,,,(((((((....)))))))})))),),|{|{({......}}}))},))).))))))))............(((((......)))))..))))))))))).,.(((((((...(((((,((,((({..................,,)))),)).)))))...))))))).,.....))))..))))))))))((((....((((((((.....))))))))...))))....)))))))))...{{{{,,,,,,|||}.,|}}.,,,,,,{||,,.}}}}}.,.})))})},,))).}}})))}},)),,,})))))}))))))))))))..))).,)))))(({,,{{{{{{..,{{{{...,})).}..}))))))))),}}}))}.|{|||,..}}})}|{(((({....)))))},.)))))))..)))))).)))))))).......)))))}}(((((......)))))..,,,,,|((((((((((.((((....))))))).))))))}}..}))))).)))))))))))))))))),))}}...,}}|||||{||}|||||.,,,((({{{,,{{,{,,,........||||,,||||||||,,||||||}||,,.|}}}}})))))))))))))....|},,|}}}}|(((({(({{.{((,{(((({{({.,{{{{,......,{{{({,.{{{{{|,||,...)).}))))).}}}||,(({(({....)))}),,.}|}},,.,||}|||||||,.,..,((((((((((((((((((((((,.,(({{{{{{|||{((,((({{((,..{{{{,|||{{|||||{{......{(({,,.....,))))))},,.})))))}}},,..}}}},.{((((((((,,{{{{((,{{{{,,..|}},.||||||||||||}|||||}|||.,{{{|||||||.}||}||.....,}},))}))}})))))}}}}}|,{|||||{|{.,,|||||}}}}},.,||||||||{{.,{,{{,.,((((.{((.....})}.)))}.{{{{{{{{{.,{|,......,|}},.,}}}}}})})))}}}}}}..|||||||,|},,,,.,,,}}}|,|..,,}.},))))))))))),}}},}}|((((..........))))|..{(({{{{,|||}...}}}|},},}},,||{|.,,..}|||||{......,}}})))|.||||||},,.(((((((.......))))))),}}.}))))),}},,...,(((,{,.........,|||{{||,{({{.{{{|,,,...|,,}}||.}}},.....((((((.({((((,{((((((........))))))))))}...)).)))))).....,,,.,,,,||{{{|||{{{{,,.||||||||||}}|}|}{{{{{...|,,..)))}},|||||||||..|||||,,}}}}},}},,,}},,,})))),,}}}},..,,,)))))},,})))))))))}})).........}}}||||||||{.(((....))).)))))))),,}.}}},,|||||}|||||||{{.....{{{......}}}....,..,}}))))))}})))))}}}}...,}.))))))),,.,,,},|,|||||||||}||}....}})))).,,,|{{|||||||||||..,,}}))))),)}}}}|(((((((.....))))))),......))))))))).)))))},)).)))))))...}}}.))))))))((((((((((({{(((..(((((........)))))..)))....}}.))))))))))){(((((.......))))))..))))))))))...(((((((({...}))))))))))))))))).)))}...........,{{{.{{{{.....,,{|||..,)))).}},}},},))))}}}}..........{({{{,...||.)))}......(((..,{,.,,))}..})).....})))))),.{(((({...}))))}...........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGAGACCAUUCCCAGUCAGCAAGGGCUUGGGAAGUGCAUACAGUUCCUG… 8294 nt 0.3581
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the krueppel C2H2-type zinc finger protein family. The encoded protein contains five zinc fingers and is likely a nuclear transcriptional regulator. Numerous transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.