Basic Information

Symbol
ZNF536
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 536 KIAA0390
Location (GRCh38)
19:30224891-30713586
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014717.3
Sequence length
4973.0 nt
GC content
0.5628

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1945.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2033.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1148.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352260.2 NCBI
GAUUUUGCUGAGGCCAGCUUUGGAACAGGGGAGGUGAGUCUGGAGAAGA… 6940 nt 0.5121
NM_001376110.1 NCBI
AUUCAUUGAACACAAUCUUUUACAACGCUCCGUUUACGUGCCCGAGUUU… 6876 nt 0.5138
NM_001376111.1 NCBI
GAGAACUCGUACAGUAGCGGCGUCAGAUCCAUCCCGCGCCUCCCAGUCC… 6961 nt 0.5136
NM_014717.3 NCBI
GAUUUUGCUGAGGCCAGCUUUGGAACAGGGGAGGUGAGUCUGGAGAAGA… 4973 nt 0.5628
Summary

The protein encoded by this gene is a highly conserved zinc finger protein. The encoded protein is most abundant in brain, where it negatively regulates neuronal differentiation. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

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