Basic Information

Symbol
ZNF711
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 711 CMPX1 DJ75N13.1 Zfp711 MRX97 ZNF4 ZNF5 ZNF6 Zinc Finger Protein 6 (CMPX1) Zinc Finger Protein 6 MRX65 Mental Retardation, X-Linked 65 DJ75N13.1 (Znf6-Like) XLID97
Location (GRCh38)
X:85243839-85273422
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001330574.2
Sequence length
4559.0 nt
GC content
0.3823

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1203.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1291.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1107.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330574.2 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4559 nt 0.3823
NM_001375431.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4180 nt 0.3806
NM_001375432.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4554 nt 0.3825
NM_001375433.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4917 nt 0.3781
NM_001375434.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4305 nt 0.3782
NM_001375435.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4779 nt 0.3758
NM_001375436.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4421 nt 0.3800
NM_001375437.1 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4416 nt 0.3802
NM_021998.5 NCBI
AGACGCAGAGUAGAUUGUGAUUGGCUCGGGCUGCGGAACCUCGGAAACC… 4162 nt 0.3760
Summary

This gene encodes a zinc finger protein of unknown function. It bears similarity to a zinc finger protein which acts as a transcriptional activator. This gene lies in a region of the X chromosome which has been associated with cognitive disability. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the ZNF711 as a shared downregulated differentially expressed gene between rhesus and pediatric human hypertrophic cardiomyopathy [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].