Basic Information

Symbol
BTC
RNA class
mRNA
Alias
Betacellulin Probetacellulin
Location (GRCh38)
4:74744759-74794717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001729.4
Sequence length
2653.0 nt
GC content
0.3867

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-698.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -753.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 614.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001316963.2 NCBI
AUUCACGGAGCCGGCCGGCCUCCCGCCCUGGGUGUUUCCCUGCCUUGUA… 2506 nt 0.3851
NM_001729.4 NCBI
AUUCACGGAGCCGGCCGGCCUCCCGCCCUGGGUGUUUCCCUGCCUUGUA… 2653 nt 0.3867
Summary

This gene encodes a member of the epidermal growth factor (EGF) family of proteins. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein that is proteolytically processed to generate the secreted growth factor. A secreted form and a membrane-anchored form of this protein bind to multiple different EGF receptors. This protein promotes pancreatic cell proliferation and insulin secretion, as well as retinal vascular permeability. Mutations in this gene may be associated with type 2 diabetes in human patients. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem tissue RNA sequencing demonstrated that septic shock induces a highly heterogeneous transcriptomic response across six organs, with the lungs and colon being most affected, showing both gene activation and strong inhibitory signals [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].