Basic Information

Symbol
ZNF827
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 827
Location (GRCh38)
4:145757627-145938823
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001306215.2
Sequence length
7651.0 nt
GC content
0.4794

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2352.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2504.6 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1769.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001306215.2 NCBI
GACAUUAGUGUUAGGGGCUCGGAGACACAGAGCGCGGCCAUAGACACCG… 7651 nt 0.4794
NM_001410850.1 NCBI
GACAUUAGUGUUAGGGGCUCGGAGACACAGAGCGCGGCCAUAGACACCG… 7618 nt 0.4793
NM_178835.5 NCBI
GACAUUAGUGUUAGGGGCUCGGAGACACAGAGCGCGGCCAUAGACACCG… 7660 nt 0.4792
Summary

Enables NuRD complex binding activity. Involved in several processes, including establishment of protein localization to telomere; negative regulation of shelterin complex assembly; and telomere maintenance. Located in chromatin and chromosome, telomeric region. Part of ribonucleoprotein complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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