Basic Information

Symbol
ZNF844
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 844 FLJ14959
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_001136501.3
Sequence length
6588.0 nt
GC content
0.4369

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2588.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.((((..(.((((((((((((((.((.((((((((......).))))))).)).))))((.((((((((((((((.....((.(((........))).))....)))).((((((((((...((((((.....))).))))))))))))))))).)))))).)).)))))))))).)..)))).))))(((.(((.(((((((.(.(.(((...))).).).)))).))).))).)))(((.((((.......))))...)))..........))))))..((((.((((...((((((((.....(((((((...............)))))))(((((((((.((((....(((((((((((((....(((((((......((..((((.....(((((.((((.((((...((((((..((((((((...............(((((((..((......((((....(((........))).....))))........))..)))))))...(((((((...(((..(((((((.((((...(((((.......(((((................((((((.(((....(((..((((........)))))))...)))))))))..........(((.(((...(((((.(((............))))))))..))).)))..)))))..((((((((((((.((....(((((((((....)))))))))(((((....)))))))))))....)))).))))............((((((..(((((((.(..(((((((...........)))))))....)))))))).............((((......)))).)))))).....((.(((.(((((((((.((((..(((((.(((((..((.....))..))))))))))(((((((.(((.(((..((((.(((((.........((((((...........))))))..((((((((.((((....)))).((((((......))))))..((((...))))..)))))))).(((((((.((.......))...))))))))))))...)))).))).)))...)))))))...(((((...(((......)))(((........)))..)))))...(((((.((...((((........)))).....)).)))))...((((((((.((((((((....)))))...........((((((((((((((((((..(((((...........)))))....))))).))))).....(((((.((..(((((((......((.((((.((.(((((((((((((((......)))))))).....))))))).)).......)))).))..)))))))......)).)))))((((((((..(((((((((((((..(((((((((((.((.((.......)))).))))).........(((((((((..........((((.(((..(((((....(((((..((.(((........)))...)))))))..)).)))..))).))))..........)))))))))..))))))))))))..))))))).......)))).))))......(((((((..((((((((((......))))))).)))...))))..)))..((((((.((((....(((((((....(((((.(((...(((((((((.((......))..)))...((((((((...((((...((((((........((((..((((......(((...(..(((((((....(((((((....(((((((((............((((....(((.(.(((((((((.....(((((((((...............)))))))))))))......))))).).)))..))))............))))))))).....)))))))...((((((......)))))).....(((((((((..((.(((..(......)..))).))..))))))))))))))))..)...))).((((((((..(((((((.((((((..(((((((..(((..((((...((..((((......))))..)).))))..))))))))))..))))))..((((((((.....((((.((((((((((.............))))).))))).))))....))))).)))((((((((...........((((((.((((((((((((((((((((((.((..((((((((((((((((((.(((..((....)).))).))...........))))))))....((.((((......)))).))(((((.((((........)))).))))).....)))))))).....))))))))))((((.((((.(((((......))))).)........)))))))......))))))))...)))))).)))))).......((((((((((((((((((........).)))).))...)))))).)))))..(((((..((.(((..(.((((((.............)))))).)..)))))....)))))......)))))))).............))))))).((...((((((....))))))...)).)))))))))))).))))))))))..........(((.((.((...((((((...........))))))...)))).)))..((((((.((((............(((.....)))............)))).))))))..((((......))))...(((...((((((((((.((((((((((.((((((.((((((((.((...((((((((((((((((((((((((.(.(((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.(((.(((((((...((((((.((((((.......((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.....))))).((((((((((((((..((((((..(((..(((((((((.((((((((((((.((((.(((....((...(((((((..(((((((((((((((((((((.(.((((((..((((((((.(.((((((((((((((((((.((((((.((((((((((..((...(((((((((((.(((.....))).)))).(((((...........((((((((((......((((((((.(...(((((...........(((((..((((((((.......))))..))))..)))))(((((.(((.((((((((((.((((...........................(((.......))).((((((.....(((((...............(((((((.(((.((.....))))))))))))..(((((........)))))((((((.(((....))))))))).....)))))))))))))))...))))))).............))).))).))))).)))))...))))))))))))))))))).......))))).......)))))))...(((((((..............((((((((((.(((.(((((((((((((...((((.((....(.((((((((...(((((.(.(((((((.((.((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((.(((..((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((.(((((((.((...(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((...((((((((....((((((..(((((.((((..(.((((..((...........(((((..(..(((((((((((((......((((.....))))...)))..(((..((((((.....))))))))).....))))))))))..)..)))))...(((......)))...((((........))))..((((((..((.((((((.....))))))))..)))))).........(((((.((.....)).))))).......))..)))).)..)))).)))))))))))....))))))))...)))))).)))))))))))))))))))))))))))))))...)).))))))).)))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))..))).)))))))).)))))))))))))))))))))..)))))))).))))))))))))))))))))))))))).)))).)).))))))).).)))))...)))))))).)))))))))))))))))))).))).))))))))))..)))))))))..)))))))))).)))))).)))))))))))))))))).).))))))))..)))))).).)))))))))))))))))))))..)))))))...))....))).)))).))))))))))))..)))))))))..)))..))))))..)))))))))))))).........))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))..((((......)))).))))))...))))))))))))))))))))))).))))))).))).))))))))).......))))))....((((...((((.(((((((((...((((((.......))))))......(((((.......))))).))))))))).))))...))))..))))))...))))))).))).)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))).).)))))))))))))))))))))))))).)))))))).)))))).)))))))))).))))))))))...)))))))))))))))..........)))))).))).)))))(((..(((......))).))).)))))))....)))).))))))...)))))))).(((........)))....))).)))))))).((((((.....)))))))))).)))).)))))..))))).)))))....))))...)))))))..))))))))))........(((.(((((.....(((((((((((((....)))))))))))))...((((.((..(((((...................((((.(((((((..(((((((((......(((..(((((((((((((......)))))))))).......(((((((......((((...)))).....))))))).........(((((...))))))))..)))..(((((((((.(((.(((((.((((((((((((((........))))))(((((((.....(((((((((((..(((((....)))))..))))))))))).((((.....)))).......((((((..........)))))).(((..(((((((.((((.(((.....)))))))...)))))))....)))...(((...(((......)))...)))....)))))))....))).)))))))))).))))))))))))..)))))))))......)))))))))))..)))))..)).))))......(((((((((((.((.(((....(((((...............)))))(((((((..((..((((..(((((...)))))...)))).....))..))))))).........(((((......)))))...(((((((((.(((...))).)))))))))..............))).)).)))))))))))))))).)))(((((((((........))))))))).)).))))))))))))..))))...)))).)))))))))..)).....)))))))..))))))(((((((((((((((....))))))..))).)))))).((((((...)))))).)))))))....(((((.....(((((((..........)))))))....)))))..)))))))))))))...(((((..((...))..)))))....)))))).)))))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUCUUUGGCCCCUCCCGCCGGGUGAGGUUGGCACCCCGUUUUUCCUGC… 6588 nt 0.4369
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the ZNF844 as a top differentially expressed gene in the nucleus accumbens in individuals with alcohol use disorder through meta-analysis of postmortem brain RNA-seq data [Willis et al. DOI:10.1038/S41380-024-02777-1].