Basic Information

Symbol
ZNF91
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger Protein 91 HTF10 HPF7 Zinc Finger Protein 91 (HPF7, HTF10) Zinc Finger Protein HTF10 Zinc Finger Protein HPF7
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_003430.4
Sequence length
5400.0 nt
GC content
0.3663

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1158.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1273.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1488.2
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUCUCUCGCUGCCGCCGGAGUUUCCAGGUCUCGACUUCACUGCUCUGUG… 5304 nt 0.3646
GUCUCUCGCUGCCGCCGGAGUUUCCAGGUCUCGACUUCACUGCUCUGUG… 5400 nt 0.3663
Summary

The ZNF91 gene encodes a zinc finger protein of the KRAB (Kruppel-associated box) subfamily (Bellefroid et al., 1991, 1993 [PubMed 2023909] [PubMed 8467795]).[supplied by OMIM, May 2010]

Forensic Context

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