Basic Information

Symbol
BTD
RNA class
mRNA
Alias
Biotinidase Biotinase Biocytinase EC 3.5.1.12 EC 3.5.1
Location (GRCh38)
3:15601341-15722311
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001370658.1
Sequence length
9964.0 nt
GC content
0.4732

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3436.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3614.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2258.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001281723.4 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGAUUUGUGGUCUGCAUUAUGUCUG… 9840 nt 0.4716
NM_001281724.3 NCBI
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NM_001281725.3 NCBI
GGGAGCUGGGAAGCCCGGCGCGCGUCGUUUGCUGGGGCUGUUUGUGCGU… 10122 nt 0.4721
NM_001281726.3 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 821 nt 0.4848
NM_001323582.2 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 10240 nt 0.4764
NM_001370658.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 9964 nt 0.4732
NM_001370752.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 1928 nt 0.4865
NM_001370753.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 2943 nt 0.4057
NM_001407364.1 NCBI
CUCUCCAUCUUCUGCCACCAUGUGAAGAUGUGCUUGCUUCCCCUUUGCC… 9928 nt 0.4721
NM_001407365.1 NCBI
AUUCCAGGAAGGUCCAUCGUACUUGCGUUUUCAGGGCCUGAGCGAUGAC… 10101 nt 0.4741
Showing 1 to 10 of 41 entries
Summary

The protein encoded by this gene functions to recycle protein-bound biotin by cleaving biocytin (biotin-epsilon-lysine), a normal product of carboxylase degradation, resulting in regeneration of free biotin. The encoded protein has also been shown to have biotinyl transferase activity. Mutations in this gene are associated with biotinidase deficiency. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

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