Basic Information

Symbol
BTD
RNA class
mRNA
Alias
Biotinidase Biotinase Biocytinase EC 3.5.1.12 EC 3.5.1
Location (GRCh38)
3:15601341-15722311
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001370658.1
Sequence length
9964.0 nt
GC content
0.4732

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3436.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3614.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2258.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001407366.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 10529 nt 0.4758
NM_001407367.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUCCUGACCAGCUCUAAAGAUGG… 10116 nt 0.4749
NM_001407368.1 NCBI
GGGAGCUGGGAAGCCCGGCGCGCGUCGUUUGCUGGGGCUGUUUGUGCGU… 10499 nt 0.4750
NM_001407369.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 10515 nt 0.4757
NM_001407370.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGCGCACGUUACUUAAAUCCAGAAG… 10392 nt 0.4748
NM_001407371.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUUCAAGACUGAUUUGACAUUGA… 10566 nt 0.4659
NM_001407372.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 10121 nt 0.4733
NM_001407373.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 10083 nt 0.4731
NM_001407374.1 NCBI
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUAAGAAGCCGAACUCUGAGGCC… 10138 nt 0.4729
NM_001407375.1 NCBI
GGGAGCUGGGAAGCCCGGCGCGCGUCGUUUGCUGGGGCUGUUUGUGCGU… 10517 nt 0.4751
Showing 11 to 20 of 41 entries
Summary

The protein encoded by this gene functions to recycle protein-bound biotin by cleaving biocytin (biotin-epsilon-lysine), a normal product of carboxylase degradation, resulting in regeneration of free biotin. The encoded protein has also been shown to have biotinyl transferase activity. Mutations in this gene are associated with biotinidase deficiency. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

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