Basic Information

Symbol
ZZZ3
RNA class
mRNA
Alias
Zinc Finger ZZ-Type Containing 3 ATAC1 ZZ-Type Zinc Finger-Containing Protein 3 DKFZP564I052 ATAC Component 1 Homolog (Drosophila) Zinc Finger, ZZ Domain Containing 3 ATAC Component 1 Homolog
Location (GRCh38)
1:77562416-77683422
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015534.6
Sequence length
6412.0 nt
GC content
0.3765

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1694.87 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1823.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1472.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308237.2 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 4919 nt 0.3716
NM_001376146.1 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 6475 nt 0.3818
NM_001376147.1 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 6412 nt 0.3815
NM_001376148.1 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 6472 nt 0.3818
NM_001376149.1 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 6409 nt 0.3815
NM_001376151.1 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 6255 nt 0.3816
NM_001376153.1 NCBI
GUUGGCAGAGCAGUUGUCCUGGAUGGCGGAGCCUUGGGUUCCGGGGGCC… 6346 nt 0.3761
NM_001376154.1 NCBI
GUUGGCAGAGCAGUUGUCCUGGAUGGCGGAGCCUUGGGUUCCGGGGGCC… 6409 nt 0.3765
NM_001376155.1 NCBI
GUUGGCAGAGCAGUUGUCCUGGAUGGCGGAGCCUUGGGUUCCGGGGGCC… 4856 nt 0.3645
NM_001376156.1 NCBI
ACCUGGAAGCGCCGCGGCGCCGCUAUCGAGCUUCCUGCAGCGGUGGCCA… 4916 nt 0.3716
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

Enables histone reader activity; lysine-acetylated histone binding activity; and methylated histone binding activity. Involved in several processes, including chromatin organization; regulation of cell division; and regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleolus and nucleoplasm. Part of ATAC complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

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