Basic Information

Symbol
BTG3
RNA class
mRNA
Alias
BTG Anti-Proliferation Factor 3 ANA BTG Family Member 3 ANA/BTG3 Tob55 APRO4 Abundant In Neuroepithelium Area Protein Protein BTG3 Protein Tob5 TOB5 B-Cell Translocation Gene 3 BTG Family, Member 3 TOFA
Location (GRCh38)
21:17593650-17613014
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006806.5
Sequence length
1410.0 nt
GC content
0.4312

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-393.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -426.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 402.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130914.2 NCBI
ACUCGUGUGCGCGCUCGUCCGCCCGCCAGUCCUCUCAACGCGCGCUUGG… 1542 nt 0.4436
NM_006806.5 NCBI
ACUCGUGUGCGCGCUCGUCCGCCCGCCAGUCCUCUCAACGCGCGCUUGG… 1410 nt 0.4312
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the BTG/Tob family. This family has structurally related proteins that appear to have antiproliferative properties. This encoded protein might play a role in neurogenesis in the central nervous system. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BTG3 was upregulated in common in white blood cells at day 1 post-injury following both burn and trauma-hemorrhage, where it was identified as a gene expression marker associated with cell-to-cell signaling pathways [Lederer et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00086.2007].