Basic Information

Symbol
BTLA
RNA class
mRNA
Alias
B And T Lymphocyte Associated BTLA1 CD272 B- And T-Lymphocyte-Associated Protein B- And T-Lymphocyte Attenuator CD272 Antigen
Location (GRCh38)
3:112461067-112499668
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_181780.4
Sequence length
3126.0 nt
GC content
0.3624

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-758.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -824.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 922.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001085357.2 NCBI
AGUUAUUUCACAGAUGCCACUGGGGUAGGUAAACUGACCCAACUCUGCA… 2982 nt 0.3551
NM_181780.4 NCBI
AGUUAUUUCACAGAUGCCACUGGGGUAGGUAAACUGACCCAACUCUGCA… 3126 nt 0.3624
Summary

This gene encodes a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded protein contains a single immunoglobulin (Ig) domain and is a receptor that relays inhibitory signals to suppress the immune response. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Polymorphisms in this gene have been associated with an increased risk of rheumatoid arthritis. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.