Basic Information

Symbol
BTNL3
RNA class
mRNA
Alias
Butyrophilin Like 3 BTNLR Butyrophilin-Like Receptor BTN9.1 Butyrophilin-Like Protein 3 Butyrophilin-Like 3 COLF4100
Location (GRCh38)
5:180988846-181006727
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_197975.3
Sequence length
2439.0 nt
GC content
0.4850

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-818.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -862.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_197975.3 NCBI
AUACUCCUCAUUCAUACAGCCAUGUUUAGGGAGGCUCUAGGGAGAAAUG… 2439 nt 0.4850
Summary

Predicted to enable signaling receptor binding activity. Predicted to be involved in T cell receptor signaling pathway and regulation of cytokine production. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in external side of plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the BTNL3 was among the top 10 differentially expressed genes when comparing blood samples from patients at 1 day versus 7 days and at 1 day versus 3 months after acute myocardial infarction [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3].