Basic Information

Symbol
ACOT2
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Thioesterase 2 ZAP128 Mte1 Acyl-Coenzyme A Thioesterase 2, Mitochondrial Acyl-Coenzyme A Thioester Hydrolase 2a Mitochondrial Acyl-CoA Thioesterase 1 Long-Chain Acyl-CoA Thioesterase 2 EC 3.1.2.2 PTE2A PTE2 Peroxisomal Long-Chain Acyl-CoA Thioesterase 2 CTE-IA CTE-Ia CTE1A
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
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MANE select

Transcript ID
NM_006821.6
Sequence length
1622.0 nt
GC content
0.5783

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-667.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -697.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 463.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
AAAGCAAACCUAGGAAGUAGCUUUCCAACAUAAAGUGGAGGUUUCAACA… 1292 nt 0.5124
GCUUAGCCUGCGACGGCAGCCCGAGAGGAUGUCUAACAAGCUUCUUUCU… 1622 nt 0.5783
Summary

This gene encodes a member of the acyl-CoA thioesterase protein family, and is one of four acyl-CoA hydrolase genes located in a cluster on chromosome 14. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ACOT2 gene was down-regulated specifically by endothelial cell-specific exposure to α-particles in liver tissue [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].