Basic Information

Symbol
C11orf96
RNA class
mRNA
Alias
Chromosome 11 Open Reading Frame 96 AG2 Uncharacterized Protein C11orf96 Protein Ag2 Homolog
Location (GRCh38)
11:43942637-43943878
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001145033.2
Sequence length
1242.0 nt
GC content
0.6916

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-583.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -599.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 488.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145033.2 NCBI
AGACGGCGACAGCAGCGGCGGCGAGCGCCUCGGAGCGCGGCGGAACAGC… 1242 nt 0.6916
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples identified the C11orf96 as a protein-coding gene with a positive coefficient in a post-mortem interval (PMI) prediction model, where it was included in an up-regulated gene cluster [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].