Basic Information

Symbol
C19orf38
RNA class
mRNA
Alias
Chromosome 19 Open Reading Frame 38 HIDE1 Highly Expressed In Immature Dendritic Cell Transcript 1 Protein HIDE1
Location (GRCh38)
19:10836567-10869791
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001136482.3
Sequence length
1210.0 nt
GC content
0.5926

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-482.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -503.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 365.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((.((...((((....))))....))))))))(((((((.(((.((((((....))))))...((((((.....(((((((((((((........)))))..))))))))...(((((.(((((........((((((.((....)).))))))........))))).)))))...(((.....)))...(((.((((((.((((((((((...)))))))))).).........))))))))((((((((((((((((.((....)).....((((.((.(((((((.((((........))))..)))..((((.((((.((((((.(((((((((((..((((.(((...)))))))..)))............))))).((((........))))(((((((.((.........(((.(((....))).))))).))).))))..))))))))).)))).))))((((((((((((((((((..((((((.((((((..((((((((...(((...........................(((((((((...(.(((((.((...((......))....)).))).)).)...))))))..)))..(((((..(((....))).)))))..(((.(........).)))...)))...))))))))..))))..)).))))))))))))).....))))...))))))).(((.(((((...(((((.((((((((((((((((..((((((.(((.(.((.....)).).)))))))))...)))))).(((((.((((....))))...))))).(((((((((((((((......)))))))))))...))))......)))))))....)))...)))))..))))))))....)))))).))))............(((((((.((((((((((..(((((....))))).......................)))))))))......).))))))).))))))))..((((((.............)))))))))))))).)))))).(((((.(((.((((((.....((((.((.(((........(((.........)))........))).)))))).))))))))).))))).((..(((....)))..))....(((((.....)))))..))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.((((..((((....{{(((..{{{{((,.,((((({((((((({((((((.....)))).}})..)).}})))).)))},..(((((((((((((........)))))..))))))))...(((((.(((((.,{,....((((((.((....)).))))))....},..))))).)))))...(((({{(.|{(.,.(((.((((((.((((((((((...)))))))))).}.........)))))))),||})},.)),))))).,)))))},}}})|(((.((......}}.}}|{,........|}}|{{|{((((((({(((({(,((((((((((.(((((..((((.(({...}))))))..,||,,.{,{{,,.|,{,{{{{((((...{{,.,}|{,({(,((,{({,{{{{{{{{((({((,.,{.,,,.)),,},})).||||.,,,,))))||{|,||{|}||((((((((((((((((((..((((((.({((((,{((((((((...(((.....,{,.....,,,...........||{{{{{{{...{.{((((,((...({......||,,.,|}.||}.},,),.,}))))}..}},.,||{{{..(({....}}}.,}})}..{{{.{.......,).)))...)))...))))))),}}))))..)}.))))))))))))).....))))...)))))))){{{.{((((.,{(((,,.{{.(((((((((((((,,((((((.(((.(.((.....)).).))))))))}..,||||||,(,{,..,|||},},)}}),,,))))).{((((((((((((((......)))))))))))...)))),,....}))))))))...)))).)}))},,||||||||..,|||,,|,,|}}}.,..........(((((((,((((((((((..(((((....)))))...,,................)})))))))))......}.))))))).)|)}))))}),)))}}}))})))}}}.},}))}}},)))},,)})))))),|,..{{((,.,,,,,}}}}..{{,{{{{{{|({,,...,.,,,,,,,,,,.,))),...,}}}}..})))).)))))))),)).)))),}).})))).}}})))}}),,,..(((((.....))))).))))..)))).,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001136482.3 NCBI
CUCCUUUCCCCGAUCUGGCCUCACAGGAGGAGUUGGCGGGGAGCCUUGG… 1210 nt 0.5926
Summary

Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the C19orf38 gene was overexpressed in menstrual blood-derived mesenchymal stem cells from women with endometriosis compared to healthy controls [Penariol et al. DOI:10.3390/ijms231911515].