Basic Information

Symbol
C1orf198
RNA class
mRNA
Alias
Chromosome 1 Open Reading Frame 198 Uncharacterized Protein C1orf198 DKFZp667D152 FLJ14525 MGC10710 FLJ16283 FLJ38847
Location (GRCh38)
1:230837119-230869589
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032800.3
Sequence length
3726.0 nt
GC content
0.5075

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1353.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1084.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001136494.2 NCBI
ACUUUUGUGUUCAGAACUAUCCAGGCAAAGACCCUGGAUAACAGCUGAA… 3821 nt 0.5033
NM_001136495.2 NCBI
ACUCCUACUCAUCUCAUCUGUCUGAGUCCAUUGGGGGGCCUCACCGGCA… 3514 nt 0.4895
NM_032800.3 NCBI
AGGCCGGGCAUGGCGUCCAUGGCGGCGGCGAUCGCGGCUUCGCGCUCGG… 3726 nt 0.5075
Summary

Located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the C1orf198 was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].