Basic Information

Symbol
C1QC
RNA class
mRNA
Alias
Complement C1q C Chain C1QG Complement Component 1, Q Subcomponent, Gamma Polypeptide Complement Component 1, Q Subcomponent, C Chain Complement C1q Subcomponent Subunit C C1Q-C C1QD3
Location (GRCh38)
1:22642558-22648110
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from respiratory system disease
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_172369.5
Sequence length
1158.0 nt
GC content
0.6002

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-466.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -484.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114101.3 NCBI
AGACACCGUGUCCUCUUGCCUGGGAGAGGGGAAGCAGAUCUGAGGACAU… 1181 nt 0.6037
NM_001347619.2 NCBI
AGACACCGUGUCCUCUUGCCUGGGAGAGGGGAAGCAGAUCUGAGGACAU… 1330 nt 0.6068
NM_001347620.2 NCBI
AGACACCGUGUCCUCUUGCCUGGGAGAGGGGAAGCAGAUCUGAGGACAU… 964 nt 0.5799
NM_172369.5 NCBI
AGACACCGUGUCCUCUUGCCUGGGAGAGGGGAAGCAGAUCUGAGGACAU… 1158 nt 0.6002
Summary

This gene encodes the C-chain polypeptide of serum complement subcomponent C1q, which associates with C1r and C1s to yield the first component of the serum complement system. C1q is composed of 18 polypeptide chains which include 6 A-chains, 6 B-chains, and 6 C-chains. Each chain contains an N-terminal collagen-like region and a C-terminal C1q globular domain. C1q deficiency is associated with lupus erythematosus and glomerulonephritis. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the C1QC is a protein marker highly expressed in Spp1low Fabp4- macrophage clusters present in both control and radiation pneumonitis lung tissue [Yang et al. DOI:10.3390/antiox11081457]. A review of myocardial infarction research in mice and humans further identified the C1QC as a marker for pro-inflammatory and repair macrophages, with its genes (C1qa, C1qb, C1qc) being highly expressed in both M1 and M2 macrophage clusters [Xinxin Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].