Basic Information

Symbol
C1QL3
RNA class
mRNA
Alias
Complement C1q Like 3 CTRP13 C1QTNF13 K100 C1ql C1q And Tumor Necrosis Factor-Related Protein 13 Complement Component 1, Q Subcomponent-Like 3 Complement C1q-Like Protein 3 C1q/TNF-Related Protein 13
Location (GRCh38)
10:16513734-16521879
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001010908.2
Sequence length
2376.0 nt
GC content
0.5652

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-935.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -974.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 631.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001010908.2 NCBI
CUCCUCUUCUCCUGGCAGGUGGUACCCAGGCAGAAUUCUGCCUUCAGUC… 2376 nt 0.5652
Summary

Predicted to enable identical protein binding activity. Predicted to be involved in neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane and postsynaptic density assembly. Predicted to act upstream of or within regulation of synapse organization. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be part of collagen trimer. Predicted to be active in glutamatergic synapse; hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; and synaptic cleft. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that a gene interaction network, including C1ql2, Cbnl, Sdc1, Bdnf, MMP9, and Cd47, was relevant following mild traumatic brain injury, with the C1QL3 being highly expressed in the central nervous system and mentioned in the introduction as involved in synapse regulation [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].