Basic Information

Symbol
C2
RNA class
mRNA
Alias
Complement C2 Complement Component 2 C3/C5 Convertase Complement Component C2 EC 3.4.21.43 EC 3.4.21 ARMD14 CO2
Location (GRCh38)
6:31897785-31945674
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000063.6
Sequence length
2610.0 nt
GC content
0.5525

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-980.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1021.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 418.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000063.6 NCBI
GGCUCUCUACCUCUCGCCGCCCCUAGGGAGGACACCAUGGGCCCACUGA… 2610 nt 0.5525
NM_001145903.3 NCBI
GGCUCUCUACCUCUCGCCGCCCCUAGGGAGGACACCAUGGGCCCACUGA… 2214 nt 0.5420
NM_001178063.3 NCBI
AGUUGACGAUGUCCCUAACAGCGAAUUCCAAGGCGCCCGUGUAGCAGGA… 2000 nt 0.5500
NM_001282457.2 NCBI
GCCAUUUUCCCCUGAGAGCGGCCUCGGAGAUGGCUGUGACUGUCCUAAG… 2059 nt 0.5435
NM_001282458.2 NCBI
GGCUCUCUACCUCUCGCCGCCCCUAGGGAGGACACCAUGGGCCCACUGA… 2638 nt 0.5534
NM_001282459.2 NCBI
GGCUCUCUACCUCUCGCCGCCCCUAGGGAGGACACCAUGGGCCCACUGA… 1644 nt 0.5274
Summary

Component C2 is a serum glycoprotein that functions as part of the classical pathway of the complement system. Activated C1 cleaves C2 into C2a and C2b. The serine proteinase C2a then combines with complement factor 4b to create the C3 or C5 convertase. Deficiency of C2 has been reported to associated with certain autoimmune diseases and SNPs in this gene have been associated with altered susceptibility to age-related macular degeneration. This gene localizes within the class III region of the MHC on the short arm of chromosome 6. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Additional transcript variants have been described in publications but their full-length sequence has not been determined.[provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.