Basic Information

Symbol
C3orf52
RNA class
mRNA
Alias
Chromosome 3 Open Reading Frame 52 TTMP TPA Induced Trans-Membrane Protein TPA-Induced Transmembrane Protein FLJ23186 Novel Endoplasmic Reticulum Transmembrane Protein HYPT15
Location (GRCh38)
3:112086335-112131004
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024616.3
Sequence length
2237.0 nt
GC content
0.4421

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-683.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -727.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 489.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001171747.2 NCBI
AGACUUUCCCUGCCGGCACAUGGACCUGGCCCAACCCUCACAGCCAGUA… 1984 nt 0.4430
NM_024616.3 NCBI
AGACUUUCCCUGCCGGCACAUGGACCUGGCCCAACCCUCACAGCCAGUA… 2237 nt 0.4421
Summary

Located in plasma membrane. Implicated in hypotrichosis 15. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human neonates with hypoxic-ischemic encephalopathy (HIE) identified the C3orf52 as one of 11 significant genes commonly associated with adverse outcome (death or disability) across cohorts from high-income countries and South Asia, though its expression was oppositely regulated, being downregulated in the high-income cohort but upregulated in the South Asia cohort in cases with adverse outcome [Montaldo et al. DOI:10.1001/jamanetworkopen.2023.54433].