Basic Information

Symbol
ACOX1
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Oxidase 1 Palmitoyl-CoA Oxidase PALMCOX Peroxisomal Acyl-Coenzyme A Oxidase 1 Acyl-Coenzyme A Oxidase 1, Palmitoyl Peroxisomal Fatty Acyl-CoA Oxidase Straight-Chain Acyl-CoA Oxidase Acyl-CoA Oxidase 1, Palmitoyl EC 1.3.3.6 ACOX SCOX AOX Acyl-CoA Oxidase, Straight-Chain MITCH
Location (GRCh38)
17:75941507-75979459
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004035.7
Sequence length
7317.0 nt
GC content
0.4397

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2459.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2591.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1564.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((((((.((((((((.(((((.(.(((((..((((((((((.....)).)))))......((.(((((((((((((((....))))..))))..))).)))).))((((....))))(((((((.....))))))).......)))..)))))).)))))...........))))))))))))((.((((........))))))((((..((((..((((((.(((((((((((....(((((.....(((((((.(.......).))))))).))))))))).)).))))).))..)))).)).))..))))(((...))))))))))(((((.((((..((((((....(((.((((((.((((((((((((((((((((((..((((..(((((((((((((((......((((((..(((....))).))))))))))))))........)))))))..))))..(((((((((((((.((.....(((.((((((((..((((((((...........((.(((((((...))).)))).)))))))))).....(((..((((...(((((.(((((...)))))....((((((....((((((((((((((((.((.((((((..............)).)))).)).))))))))).....((.(((.(((((((....(.((..((((.((........))))))..)))...)))).))).))).)).((.....))(((.((..(((((...(((....)))...)))))..)).)))...)))))))....))))))........................((((((.....))))))((((((.((((((((((((.((((.((((...(((.(((((.........))))))))...))))))))))))))))..)))))))).)))))))...)))))))))))))))..)))((.((((((.(((((((((((....(((....)))...(((((((((((......(((........)))...)))))))))))........(((((((....((((......((((((((((.(((((((((..((((.....)))).))))...((((((...))).))).((......)).))))).))))).)))))....))))..)))).))).((((((((((......((.(..(.(.(((......))).).)..).)).......)))).)))))).)))))))))))..)))))).))((((......)))))))))))))).)))))....(((((.((.((((.(((((((.......)))).))).))))....)).)))))...)))))).))))((((.((((((.(.......).)))))).)).))))))...((((((((((((((.(((((.(.....).)).)))))))......))))).)))))....((((((.((((.(((.(((((((((((.....(((.((((((((...((((......(((((((...(((.(((((((((((((.((((......)))).......((((.....))))(((.(((((.....((((((((((((((.((.((((((((.((((.(((((((((((((((((((...(((((((.(((...((((((.((((((((((....)))....((((((.(((((((((((..(((.......))))))))...))))))...(((((((.(((((......)))))))).))))....(((((....))))).)))))).......((((((((.....((((((............))))))(((.(((((....(((((.....((((((((....((....))....))))))))...)))))..))))).)))))))))))))))))).)))))).))).)))))))......)))))))).((((((..........))))))(((((((((((((..........((((((.((((.(((((.((((((.........(((((((((((.....)))...........))))))))..((((....))))...(((...(((.((((((((..(((...........(((....)))...............((((((........)))))).......))).)))))))).))).....)))......)))).))))))).)))).......((((((((.(((..((((....(((((((.(((((((.(((((((.(((.(((...............((((((((..(((.((.......)).)))...))))))))...((((((((...)))))))).....(((((((((((((((((((.((((.........)))).))...))))..(((.((((((((((...(((((((.((....(((......))).)).)))))))...))))...((((((.((((((((((((((((..........(((((((((.....(((((((((((.(...........).)))))))))))......).)))))))).)))))))....((((((((((.(((...((((..((......))..))))(((((....(((..((((((((...((((((((((((((((...))))........))))))).....))))).)))).))))..))).))))).....))))))))).))))(((((((..(...((((.(((((((((....((((.(((..(((..(((((((((((.(((((.....))))).))...)))))))))..))).))))))))))))....)))).)))).)..)))))))(((((((.......))))))).)))))))))...))))))........)))))).))).....(((((.....)))))(((((........)))))....))))))).))))))((((((((((((........))))))))))))(((((((...(((((..((((.((((((((.((....)).)))))))).....))))..))))).))))))))))))))))))))..))))))).)))))))...)))).)))))))))))............................((((.((((..((((............))))..)))).))))...))))))...))))))))))))).((((((((((..(((((((..((((.((......(((...)))......)).)))).)))))))........(((....)))...(((((...)))))..((((((((((((......(((((((((((.(((....((((.(((....(((((((((....)))....)).))))..))).)))))))))))).)))))).........))).)))))))))))))))))))......(((((((...(((....))).(((((.((((.((((...(((..(((((((((...........((((.....))))...((((((((........))))))))....(((((....)))))(((((.(((((((..(.(((((((......))))))).)..))))...))).)))))(((..(.((((((((((((((.....)))..)))))))))))).))).....(((((........(((((....)))))......)))))(((.((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(.(((((((((((..(((((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((.(((((((((((((((...((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((..(((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((..(((((((.((((..(.(((((((((..(((((((((..((((((((((((((((..((((((((((.(((.((.(((((((((((.((((((((..((((......))))....)))))))).......))))))))))).))))).))))..)))))).......((((((((((((....(((.(((..(((....))).((((((((.......))))))))..(((((((.......(((((((.(((((((.((......(((.(((.......))).))).((((((((((((.....)))))))..))))).....((((((((((.((.((((.((((((..........)))))))))).)).)).))))))))...)).)))).))).)))))))(..(((((((.(((.(((.((..........)).))).))))))))))..)...(((((((((...))))))))).....((((((((.((((((..(((......)))......(((((((((....(((((.....((((((.....))))))......))))))))))))))..(((((.((((((...))).))))))))))))))...))))))))...)))))))((((...((((....(((((...((((.(((((....)))))((((((((......(((....)))......)))))))).....((((((.......))))))..))))....)))))...)))))))).((((((((..((((((((((..((((.....))))((((((((.....)).))))))......((..((((((.(((((((((((((.((((((((((((((...((((..((((((((..((((((...((((..((((((......)))))).)))).))).)))...))))))))..(((((...((((((.......((((((((((((...((((.(((.(((.(((((..(((((.(.(((((((..........((((.((...(((........)))...)).))))(((((.(((((.((((...(((((((((((((((((.......)))))..........(((((....)))))...(((((((((...(((((.....)))))...)))..))))))(((((.((.....)).)))))(((((((((....((..(((.(((....))).)))..)).....))))..)))))..............))))))))))))......((((((.(((...((...((((((.......))))))...))..)))...))))))....(((((((((...((((....(((....))))))).)))))))))((((.....))))...))))..........(((((((..........)))))))((((..(((......)))....))))))))).)))))...((((.(((((.......))))).)))))).))))).).))))).....))))).)))))).))))...))))))))))))))))))...))))).....(((((((((((...(((.((.(((((((((.(((.(((....)).).))).))))...))).)).)).))))))....((..((((...(((((....)))))((((((((......(((....)))......))))))))((((((((.......))))))))))))..))..(((((((((..(((((...((............(((((((((....))))).))))......(((....)))....))....)))))..)))))))))...)))))))).)))).))))))))))))).).)))))..)))))(((........)))...........(((((...))))).(((.((((.....))))..)))....))).))))))....))((((((((.............(((((.(((.(((....)))..))).).))))...(((((((((........)))))))))..((((((((....))))))))..(((.(((((((.......)))).))).))).((((((......))))))..)))))))))))).))))))..)))).)))).(((((.....)))))(((((((((.(((..((((..((((((((((((........((((((..(((((((.....))))))))))))).......(((((....)))))))))))))).(((((.........))))).......)))))))..))).))))))))).))).))).....))))))))))))))))))))))))))))..)))))))))..))))))))).)..)))).)))))))..)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))((((.......))))..............)))))))))....)))..)))).).))).)))))..)))))))...........))))).....)).)))).)))).)))))..))).))(((((((...((((((((((.((((.........)))).))))))((..((((((((((((.....((((((((((((....((((((((((....))))))))))))...((((...(((((.....)))))...))))))))))))))....(((.((.......)).))).........(((((......))))).((((....))))..))))).)))))))..)).)))))))))))........)))))))........)))))))..))))).)))))))))))((((....))))...))))).))).)))))))(((.((((.(((((.((((..((...))..)))).))))).))))..)))...)))).)))))).......)))))....))))))))))).))))))).))))))......(((......)))..........)))).....)))).))).))).)))))))))...))))..)))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((((((((({{(((((((((((((((((.,,.....(.(((((((.....)).)))))}....,(({((,((.((.((((,,......,....,,)))).)}}}.)),)))))),.))))}}))))......(((.((((((..{.{,.....))...)))))).))).,.....))))))))))))((.((((,......,)))))),,,({{,((({{((((({.(((((((({{{....{||||,.,,.(((((((.(.......).))))))).))}}}}}}},}|.}}})).)}..,,,}.}}.))}}))))))..}})..)))))))(((((.((((..((((((...,(({.((((((.((((({((((({((((((((((.,((((..(((((((((((((((......((((((..(((....))).)))))))))))))),.......}))))))..))))..(((((((((((({{({....,(((.((((((((..((((((((,..........{(.(((((((...))).)))).)})))))))).....((({{,(((...(((((.(((((...)))))....((((((....((((((((((((((((.((.{(((((..............)),}))}.)).))))))))).....((.(((.(((((((....,.,{,,{((,.((........})}}}}..,}}},.)))),,)).))).)).{{.....||{{{}||,.(((((...(({....}))...)))))..}}.}}}...)))))))....)))))}......,.,,.,,|.....},...((((((.....))))))((((((.((((((((((((,(({{.((((...(((.(((((.........))))))))...)))))))))))))))),.}))))))).)))))))}}},)),)))))))))))..)))((.((((((.(((((((((((..{.(((,...|}}.,.{((((({{(((..,...(((........}})...)}))))))})}........(((((((....((((......((((((((((.(((((,{((,,(({,,,..{|}}}.))),,..,|||||...})}.}},.((......)).))))).)))))},))))....))))..))))},)).((((((((((......((.(..(.{.(((......))).}.)..).)).......)))),}))))).)))))))))))..)))))).)){{{|......,}},})))))))))}}))))....(((((.((.((((.(((((((.......)))).))).))))....)).))))).,.)))))).))))}}||,((((((.{.......}.)))))).||,|,||||,..({(((({((((((,.(((((.(,....|.,},,},})}},,,..,)}))).))))),,,.((((((.((((.(((.(((((((((((...,.({.,((((((((...((((...,..{({{{{{...||,.|((((((,,((((....,.,}},)))))}......((((.....)))).|..,((((,....(((((((((((.(((((,,.....(((((((((,,,,((((((((((((((...(((((((.(((.,.{(((((.((((((({({....,}}.{{((((((......,.(((((..{((.......)))))))).})))))))..{((({(((,{((((,,,...}}}}}))).)))),,},||{||,,,,|||}}.}))))).......((((((((.....{(((((..{{......}})))))},{{,(((({,,,,{((((.....((((((((....((....))....))))))))...)))))..))))).))}))))))))))))))),))}))).))).)))))))......)))))))),((((((..........))))))}}}}}}))))))))),.,.}.......))))))))}(((((..{(({((((,.,{.((((((((({,...,,|||{,,......|{|||})))}.,||{(.,.{||||,{{,.....{{({((((({,....,,{,..,,{....({{,,,,|||,,,|||,..,||{{,((((((........)))))).....,{{{{.{{{{||||,||,{{,,.,{{,,.{{{(({,,,||}}|,,{{||..,,...((((((((.(((..((((..,.(((((((.(((((((.(((((((.(((.{((,........|,....{((((({{,.||||||.{{,,.,|{.,{{{,,||||||||,,.{(((((((...)))))))}......,{((((((,,,,.((((.....|}}}.....,))))}.....{|({{((({.,{{{{(((((,{.(((((((.{{....(((......))}.}}.))))))),..}}}}...||||{|,||{||{{{{{((((((..........((((((((,.,,..(((((((((((.(...........).))))))))))).,}}..}.)))))))).))))))),,..{{{|{{||{(,(({{,.{{||..||,...,,}},,)}}}{{{{{,,,,(((..{({{((((...((((((((((((((({...})))........))))))).....))))).)))).}))).,))).))))).,,}}})}})))}),))}|{{(((((..,...((((.(((((((((....((((.(((..(((..((((((((({{.(((((.....))))).}}.,,)))))))))..))).))))))))))))....)))).)))).},.))))))}|((((((.......))))))).}}})))))),..||||||..||....}|||||,||,,,||,{((({....,|||}|(((((........))))),.,,}),},,,.))))}|{{{|||||||,,.,}}..}}))))}}|||||{(((((((...(((((..((((.((((((((.({....,).)))))))).,...))))..))))).))))))))}}))))))))))..))))))).))))))).}.)))).)))))))))))}}}}}}}}..}}}},..........,.,,,,.,{(((({{{.,,.,,,,,..}},}}}}},....,,,))}}}),,,.}}}},)))}})))||||||,||,|||,{,.(((((((..((((.((......(((...,}}...,,,)).)))).)))))))...,}},,|||}},.,,....{((({...})))}..((((((((((((......(((((((((((.(((....((((.(((....(((((((((....)))}...})}})))..))).)))))))))))).)))))).........)))}})))))))),},,{{|{(((((((.....))))))))}}.,.,,(((,.....}}},{{{|.{{(({,{({{,,....,,....,}}}.||||,....)))),..((((((((........))))))))...{({{{,,{{,|,,,,)}}})}}}}||{{..{.(((((((......))))))).}..)))),)))))}}},},||{..{.((((((((((((((.....,},}})))))))))))},}||..{{{((((,,.......,{{{,....}},,,{{{|{{||||((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(.(((((((((((..(((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((((((((({,,,{(((((((((((((.{((((((((((((((...((({,(((((((((((((.(((((((((((((((((((,.{((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((..(((((((.((((..(.(((((((((..(((((((((..((((((((((((((({..((((((((((.(((,,{.(((((((((((.((((((((..((((......))))....)))))))).......))))))))))).,)))).))))..)))))).......{((((((((((({.((.((((.(,.,(({{{..,,}||||,,{{.{,,,....}|||||,{(((((((.......(((((((.(((((({.(({{,,..(((.(((.......))).))),(((({(((((((.....)))))))..})))).,.{.((((((((((.((.((((.((((((..........)))))))))).)).)).)))))))),.,))})))).))).)))))))(..((((((,,(((.(((.((,.......,.)).))).))))))))))..),,,(((((((((...))))))))).,,..((((((((.((((((..{{{......}}}......(((((((((....{((((.....(((((({....})))))......))))))))))))))..(((((.((((({...})).))))))))))))))...)))))))).,,)))))))((((...((((....(((((...((((.(((((....)))))((((((((.,....(((....))).....,))))))))....{((((((.......)))))},}))))....)))))...)))))))).((((((((..((((((((((..((((.....))))((((((((.....)).))))))......((,.((((((.((({{((((((((.{(((((((((((((..,((((..{(((((((..((({((...((((..{(((((......}))))}.)))).}}).}}}...})))))}},,{{{||.,.{{{{|,,,,....((((((((((((...((((.(((.(((.(((((,{(((((.(.(((((((..........((((.((...{{{......,,}}}...)).))))(((((.(((((.,(((..((((((((...(((((((.......)))))))....,,,,(((((....))))),,{(((((((((...(((((.....)))))...)))..)))))))},,,{((((({{(({.....(((((((((....((..(((.(((....))).)))..)).....))))..))))).....(((((,(,..(((((((...)))))))....)).)))))}))))))))},|...|,,,.,,,....)))).))))..)))|(((((((((((((((...(((({...,,,....},))))).))))))))|((((.....))))},{{,(({(({...{{{(((((({..........))))))))))..}|||}}.}..},},))))))}))))).)))))...((((.(((((.......))))).))))}}}))))).).))))).....))))).)))))).))))...)))))))))))).,.................{{(((((({{{,,.(((.({.((((,((((.{{,,||{....)).),))).))))...)}},)),)}.))},,|||{,({..{(((,,.(((((....))))){{{{||||......(((....)))....,,)))))))}((((((((.......))))))))))))..))..(((((((((..(((((..,((............(((((((((....))))).))))......(((....)))....)}.,..)))))..)))))))))...}))))})}.)))}.))))))))))))).}.)))))..)))}|((({........))}}},...,,,.(((({...})))).,||,{{{{.....}}))..}}}....))).))))))..,,)|((((((((,({,...,,,,..(((((.(((.(((....)))..))).).))}}...(((((((((........)))))))))..{{{{{{{{....}}))))))..{((.(({{{{{....,,.))))}})}.))}.((((((......)))))),.)))))))))))).))))))..)))).)))),(((({....,|||}}{,,{,{{{{{{{{{{{.,....,,||{{((({{.....,..((((({..(((((((.....)))))))}))))).......(((((....)))))}}})))))),{(((|.........})))).....||}}}}|||,,}))}},..}}}.}})))).)).,,..))))))))))},))))))))))))))))..)))))))))..))))))))).)..)))).)))))))..)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))),})))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))))))}}}))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).))))((({{.....,,,|...}}}}},,,,..,|,|||,||,,..{{{{.,{{|{|,{{,{|,,,,....,|}}},,,}||}..,|}||,..,,,..},)}}.))}})),))}},||||(({....}))}},...,((((({.,((({{,....,})))).})))))},)))))))..))}}}}},}}(((((((({({{....((((((((((....))))))))))}},..((((.,,{((((.....))))}..,))))))))))))))....,,))),}},,))))},))},,.,))))){{(((......})))}.,.(((((({||,.....,,..}))))))....(({((((.,.........)))).))}.......,))))))).})))){{||{{||,,,,(((((....)))))...)).)}))))}}}}}||(((.((((.(((((.((((..((...))..)))).))))).))))..)))},.)))).)))))).......)))}},,..))))))))))).))))))).))))))......{((......))}..........)))}....,)))).))).))}.}}}))))))...))))..)))))...,,|......,,,.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001185039.2 NCBI
GCCUCCUAGGGUCCGGCCGGCGCUGGAGCUGCGGAUUUAGAUUGUCACU… 7491 nt 0.4452
NM_004035.7 NCBI
GCCUCCUAGGGUCCGGCCGGCGCUGGAGCUGCGGAUUUAGAUUGUCACU… 7317 nt 0.4397
NM_007292.6 NCBI
GCCUCCUAGGGUCCGGCCGGCGCUGGAGCUGCGGAUUUAGAUUGUCACU… 7317 nt 0.4375
Summary

The protein encoded by this gene is the first enzyme of the fatty acid beta-oxidation pathway, which catalyzes the desaturation of acyl-CoAs to 2-trans-enoyl-CoAs. It donates electrons directly to molecular oxygen, thereby producing hydrogen peroxide. Defects in this gene result in pseudoneonatal adrenoleukodystrophy, a disease that is characterized by accumulation of very long chain fatty acids. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the ACOX1 in microglia, indicating impairment of peroxisomal fatty acid oxidation pathways as part of broader methamphetamine-induced neurotoxicity [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649]. In a separate investigation, subacute thallium exposure in aged mice significantly decreased renal ACOX1 protein levels, specifically inhibiting peroxisomal β-oxidation and disrupting energy metabolism in a sex-specific manner [Yao et al. DOI:10.1016/J.Fct.2025.115700].