Basic Information

Symbol
C6orf132
RNA class
mRNA
Alias
Chromosome 6 Open Reading Frame 132 BA7K24.2 LncCCLM Cervical Cancer Lymphatic Metastasis-Associated LncRNA Uncharacterized Protein C6orf132
Location (GRCh38)
6:42092233-42142620
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164446.3
Sequence length
6385.0 nt
GC content
0.5892

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2606.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2712.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1652.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164446.3 NCBI
AUUUCCCGGCAAGCGGCGGCGCCCGCAGCACCUGUUGCCCGGUGCGCGG… 6385 nt 0.5892
Summary

Long noncoding RNAs (lncRNAs) contain more than 200 nucleotides and interact with DNA, RNA, and/or proteins to regulate cellular processes at the transcriptional and/or translational levels. The C6ORF132 gene produces a lncRNA termed lncCCLM (Chen et al., 2021). [supplied by OMIM]

Forensic Context

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