Basic Information

Symbol
C8B
RNA class
mRNA
Alias
Complement C8 Beta Chain Complement Component 8, Beta Polypeptide Complement Component 8 Subunit Beta Complement Component C8 Beta Chain C82
Location (GRCh38)
1:56929099-56974383
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000066.4
Sequence length
2040.0 nt
GC content
0.4804

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-656.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -699.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 559.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000066.4 NCBI
GGCACUCACAGCACAGGCUUGUUAUGGGUCUAGCAGCCUCUGUGGCAUC… 2040 nt 0.4804
NM_001278543.2 NCBI
GGCACUCACAGCACAGGCUUGUUAUGGGUCUAGCAGCCUCUGUGGCAUC… 2262 nt 0.4713
NM_001278544.2 NCBI
GGCACUCACAGCACAGGCUUGUUAUGGGUCUAGCAGCCUCUGUGGCAUC… 2169 nt 0.4809
Summary

This gene encodes one of the three subunits of the complement component 8 (C8) protein. C8 is composed of equimolar amounts of alpha, beta and gamma subunits, which are encoded by three separate genes. C8 is one component of the membrane attack complex, which mediates cell lysis, and it initiates membrane penetration of the complex. This protein mediates the interaction of C8 with the C5b-7 membrane attack complex precursor. In humans deficiency of this protein is associated with increased risk of meningococcal infections. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2013]

Forensic Context

A review of human studies in sudden cardiac death (SCD) research notes that the C8B shows significant elevation in cases of acute myocardial infarction [Cătinas and Hostiuc DOI:10.3390/ijms26146818].