Basic Information

Symbol
CA4
RNA class
mRNA
Alias
Carbonic Anhydrase 4 Carbonic Anhydrase IV CAIV Car4 Carbonate Dehydratase IV CA-IV RP17 Retinitis Pigmentosa 17 (Autosomal Dominant) Carbonic Dehydratase IV EC 4.2.1.1
Location (GRCh38)
17:60147838-60170899
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000717.5
Sequence length
1123.0 nt
GC content
0.5833

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-444.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -462.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000717.5 NCBI
ACCCGCGGCGGCCUCCUCGGUGCGCGACCCCCGGCUCAGAGGACUCUUU… 1123 nt 0.5833
Summary

Carbonic anhydrases (CAs) are a large family of zinc metalloenzymes that catalyze the reversible hydration of carbon dioxide. They participate in a variety of biological processes, including respiration, calcification, acid-base balance, bone resorption, and the formation of aqueous humor, cerebrospinal fluid, saliva, and gastric acid. They show extensive diversity in tissue distribution and in their subcellular localization. This gene encodes a glycosylphosphatidyl-inositol-anchored membrane isozyme expressed on the luminal surfaces of pulmonary (and certain other) capillaries and proximal renal tubules. Its exact function is not known; however, it may have a role in inherited renal abnormalities of bicarbonate transport. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CA4 gene was identified as a key gene upregulated in a specific endothelial cell subpopulation (Endothelial Cells-2) during myocardial infarction using single-cell RNA sequencing analysis [Mao et al. DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151820].