Basic Information

Symbol
CA5A
RNA class
mRNA
Alias
Carbonic Anhydrase 5A CA5 CAVA CAV Carbonic Anhydrase VA, Mitochondrial Carbonic Anhydrase 5A, Mitochondrial Carbonate Dehydratase VA EC 4.2.1.1 CA-VA Carbonic Anhydrase V, Mitochondrial Carbonic Anhydrase VA Carbonic Dehydratase GS1-21A4.1 CA5AD
Location (GRCh38)
16:87881546-87936580
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001739.2
Sequence length
1113.0 nt
GC content
0.5409

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-393.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -415.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 301.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001367225.1 NCBI
AGUGGUCCUGAUCAAAGUGAGAACAGACAGCAGGGAACAUCACCCUCUU… 1244 nt 0.5450
NM_001739.2 NCBI
AGUGGUCCUGAUCAAAGUGAGAACAGACAGCAGGGAACAUCACCCUCUU… 1113 nt 0.5409
Summary

Carbonic anhydrases (CAs) are a large family of zinc metalloenzymes that catalyze the reversible hydration of carbon dioxide. They participate in a variety of biological processes, including respiration, calcification, acid-base balance, bone resorption, and the formation of aqueous humor, cerebrospinal fluid, saliva, and gastric acid. They show extensive diversity in tissue distribution and in their subcellular localization. CA VA is localized in the mitochondria and expressed primarily in the liver. It may play an important role in ureagenesis and gluconeogenesis. CA5A gene maps to chromosome 16q24.3 and an unprocessed pseudogene has been assigned to 16p12-p11.2. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.