Basic Information

Symbol
CAB39L
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Binding Protein 39 Like BA103J18.3 MLAA-34 MO2L Calcium-Binding Protein 39-Like Mo25-Like Protein Antigen MLAA-34 FLJ12577 MO25beta Calcium Binding Protein 39-Like Sarcoma Antigen NY-SAR-79 U937-Associated Antigen MO25-BETA
Location (GRCh38)
13:49308629-49444342
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001079670.3
Sequence length
3502.0 nt
GC content
0.4280

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1008.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1082.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1065.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001079670.3 NCBI
GCACUGUAGCUGAGCCAAUGGAGUUACUCGUAGUCGAGAGGCCGGCAUC… 3502 nt 0.4280
NM_001287337.2 NCBI
GCACUGUAGCUGAGCCAAUGGAGUUACUCGUAGUCGAGAGGCCGGCAUC… 3640 nt 0.4272
NM_001287338.2 NCBI
GGAUUUCUUGUAGAAGCCAGUUAAAAGGAGAACCUAGUAUCACACUAGG… 3697 nt 0.4320
NM_001287339.2 NCBI
GGAUUUCUUGUAGAAGCCAGUUAAAAGGAGAACCUAGUAUCACACUAGG… 3366 nt 0.4308
NM_030925.4 NCBI
AUCUGAAAGCAAGUGUUAGAGAGGGAGUGGAGAACGCAUAAGCAAGCUG… 3619 nt 0.4266
Summary

Predicted to enable protein serine/threonine kinase activator activity. Predicted to be involved in intracellular signal transduction. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be part of serine/threonine protein kinase complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in Sprague-Dawley rats demonstrated that the CAB39L was predicted as an upstream master regulator of neurodegeneration-associated genes at 3 days post-tibial fracture via Ingenuity Pathway Analysis [Deng et al. DOI:10.1038/s41598-025-17561-6].