Basic Information

Symbol
CACNA1G
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Voltage-Gated Channel Subunit Alpha1 G NBR13 Cav3.1 Calcium Channel, Voltage-Dependent, T Type, Alpha 1G Subunit Voltage-Dependent T-Type Calcium Channel Subunit Alpha-1G Voltage-Gated Calcium Channel Subunit Alpha Cav3.1 Cav3.1c Voltage-Dependent T-Type Calcium Channel Alpha 1G Subunit Voltage-Dependent Calcium Channel Alpha 1G Subunit Ca(V)T.1 KIAA1123 SCA42ND SCA42
Location (GRCh38)
17:50560715-50627474
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018896.5
Sequence length
8602.0 nt
GC content
0.6104

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3676.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3820.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2015.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256334.2 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8053 nt 0.6100
NM_001256359.2 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8242 nt 0.6122
NM_001256360.2 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8215 nt 0.6122
NM_001256361.2 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8209 nt 0.6124
NM_018896.5 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8602 nt 0.6104
NM_198376.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 7984 nt 0.6106
NM_198377.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8569 nt 0.6106
NM_198378.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8290 nt 0.6113
NM_198379.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8365 nt 0.6128
NM_198380.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8434 nt 0.6122
Showing 11 to 20 of 28 entries
Summary

Voltage-sensitive calcium channels mediate the entry of calcium ions into excitable cells, and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division, and cell death. This gene encodes a T-type, low-voltage activated calcium channel. The T-type channels generate currents that are both transient, owing to fast inactivation, and tiny, owing to small conductance. T-type channels are thought to be involved in pacemaker activity, low-threshold calcium spikes, neuronal oscillations and resonance, and rebound burst firing. Many alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the CACNA1G as a shared downregulated differentially expressed gene in the left ventricular tissue of animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to pediatric human cases [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].