Basic Information

Symbol
CACNA1G
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Voltage-Gated Channel Subunit Alpha1 G NBR13 Cav3.1 Calcium Channel, Voltage-Dependent, T Type, Alpha 1G Subunit Voltage-Dependent T-Type Calcium Channel Subunit Alpha-1G Voltage-Gated Calcium Channel Subunit Alpha Cav3.1 Cav3.1c Voltage-Dependent T-Type Calcium Channel Alpha 1G Subunit Voltage-Dependent Calcium Channel Alpha 1G Subunit Ca(V)T.1 KIAA1123 SCA42ND SCA42
Location (GRCh38)
17:50560715-50627474
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018896.5
Sequence length
8602.0 nt
GC content
0.6104

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3676.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3820.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2015.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_198382.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8254 nt 0.6118
NM_198383.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8389 nt 0.6102
NM_198384.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8323 nt 0.6112
NM_198385.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8467 nt 0.6120
NM_198386.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8269 nt 0.6116
NM_198387.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8221 nt 0.6120
NM_198388.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8200 nt 0.6122
NM_198396.3 NCBI
GUGCGCGGGGCUCCUCGCCGCCGCUUUCGCUCGCUCGCUCCGCGUCUCG… 8500 nt 0.6112
Showing 21 to 28 of 28 entries
Summary

Voltage-sensitive calcium channels mediate the entry of calcium ions into excitable cells, and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division, and cell death. This gene encodes a T-type, low-voltage activated calcium channel. The T-type channels generate currents that are both transient, owing to fast inactivation, and tiny, owing to small conductance. T-type channels are thought to be involved in pacemaker activity, low-threshold calcium spikes, neuronal oscillations and resonance, and rebound burst firing. Many alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the CACNA1G as a shared downregulated differentially expressed gene in the left ventricular tissue of animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to pediatric human cases [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].