Basic Information

Symbol
CACNG3
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Voltage-Gated Channel Auxiliary Subunit Gamma 3 Neuronal Voltage-Gated Calcium Channel Gamma-3 Subunit Calcium Channel, Voltage-Dependent, Gamma Subunit 3 Voltage-Dependent Calcium Channel Gamma-3 Subunit Transmembrane AMPAR Regulatory Protein Gamma-3 TARP Gamma-3 Voltage-Gated Calcium Channel Gamma Subunit
Location (GRCh38)
16:24256286-24362412
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Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006539.4
Sequence length
1917.0 nt
GC content
0.5232

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-582.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -616.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 413.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006539.4 NCBI
ACACUCACACAGAGACCUCUCUGGGUUUCUUUGCCUUGAGUCUCCCGGG… 1917 nt 0.5232
Summary

The protein encoded by this gene is a type I transmembrane AMPA receptor regulatory protein (TARP). TARPs regulate both trafficking and channel gating of the AMPA receptors. This gene is part of a functionally diverse eight-member protein subfamily of the PMP-22/EMP/MP20 family. This gene is a susceptibility locus for childhood absence epilepsy. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CACNG3 was upregulated 2.31-fold in injured dorsal root ganglia following spinal nerve ligation, indicating its significant differential expression in a neuropathic pain model [Wu et al. DOI:10.1177/1744806916629048].