Basic Information

Symbol
CACNG4
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Voltage-Gated Channel Auxiliary Subunit Gamma 4 Neuronal Voltage-Gated Calcium Channel Gamma-4 Subunit Calcium Channel, Voltage-Dependent, Gamma Subunit 4 Voltage-Dependent Calcium Channel Gamma-4 Subunit Transmembrane AMPAR Regulatory Protein Gamma-4 TARP Gamma-4 MGC11138 MGC24983
Location (GRCh38)
17:66964707-67033400
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014405.4
Sequence length
3583.0 nt
GC content
0.5864

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1380.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1445.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 963.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014405.4 NCBI
ACUCGUCGCCGCGCCUCGGAGUUUGAGCCCCAGCGCUGCCGGAGCGCAG… 3583 nt 0.5864
Summary

The protein encoded by this gene is a type I transmembrane AMPA receptor regulatory protein (TARP). TARPs regulate both trafficking and channel gating of the AMPA receptors. This gene is part of a functionally diverse eight-member protein subfamily of the PMP-22/EMP/MP20 family and is located in a cluster with two family members, a type II TARP and a calcium channel gamma subunit. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

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