Basic Information

Symbol
CACNG7
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Voltage-Gated Channel Auxiliary Subunit Gamma 7 Neuronal Voltage-Gated Calcium Channel Gamma-7 Subunit Calcium Channel, Voltage-Dependent, Gamma Subunit 7 Voltage-Dependent Calcium Channel Gamma-7 Subunit Transmembrane AMPAR Regulatory Protein Gamma-7 TARP Gamma-7
Location (GRCh38)
19:53909278-53943950
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_031896.5
Sequence length
2754.0 nt
GC content
0.6195

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1208.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1254.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 653.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001384801.1 NCBI
AGUAGCCAAUGAGCGGCCGCCGGUUCCUGCUCCCGGCUCCGUCCGCCGA… 2608 nt 0.6246
NM_031896.5 NCBI
AGUAGCCAAUGAGCGGCCGCCGGUUCCUGCUCCCGGCUCCGUCCGCCGA… 2754 nt 0.6195
Summary

The protein encoded by this gene is a type II transmembrane AMPA receptor regulatory protein (TARP). TARPs regulate both trafficking and channel gating of the AMPA receptors. This gene is part of a functionally diverse eight-member protein subfamily of the PMP-22/EMP/MP20 family and is located in a cluster with two family members, a type I TARP and a calcium channel gamma subunit. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly downregulated the CACNG7 in oligodendrocytes, as identified through single-cell RNA sequencing analysis of cortical glial cells [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].