Basic Information

Symbol
CADPS2
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Dependent Secretion Activator 2 CAPS2 Calcium-Dependent Activator Protein For Secretion 2 Calcium-Dependent Secretion Activator 2 Ca2+ Dependent Secretion Activator 2 CAPS-2 Ca++-Dependent Activator Protein For Secretion 2 Ca2+-Dependent Activator Protein For Secretion 2 Ca++-Dependent Secretion Activator 2 KIAA1591
Location (GRCh38)
7:122318411-122886779
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017954.11
Sequence length
5768.0 nt
GC content
0.4209

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1631.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1740.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1655.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001009571.4 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5645 nt 0.4205
NM_001167940.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5780 nt 0.4211
NM_001363389.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5804 nt 0.4213
NM_001363390.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5789 nt 0.4213
NM_001363391.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5780 nt 0.4213
NM_001363392.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5684 nt 0.4212
NM_001363393.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5669 nt 0.4212
NM_001363394.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5660 nt 0.4210
NM_001363395.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5651 nt 0.4210
NM_001363396.2 NCBI
AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… 5648 nt 0.4209
Showing 1 to 10 of 15 entries
Summary

This gene encodes a member of the calcium-dependent activator of secretion (CAPS) protein family, which are calcium binding proteins that regulate the exocytosis of synaptic and dense-core vesicles in neurons and neuroendocrine cells. Mutations in this gene may contribute to autism susceptibility. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2009]

Forensic Context

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